Protein–RNA interactions for Protein: O43927

CXCL13, C-X-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL13O43927 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CXCL13O43927 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CXCL13O43927 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CXCL13O43927 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CXCL13O43927 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CXCL13O43927 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CXCL13O43927 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CXCL13O43927 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CXCL13O43927 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CXCL13O43927 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CXCL13O43927 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CXCL13O43927 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CXCL13O43927 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CXCL13O43927 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CXCL13O43927 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CXCL13O43927 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CXCL13O43927 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CXCL13O43927 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CXCL13O43927 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CXCL13O43927 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CXCL13O43927 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CXCL13O43927 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CXCL13O43927 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CXCL13O43927 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CXCL13O43927 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CXCL13O43927 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CXCL13O43927 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CXCL13O43927 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CXCL13O43927 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CXCL13O43927 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CXCL13O43927 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CXCL13O43927 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CXCL13O43927 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CXCL13O43927 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CXCL13O43927 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CXCL13O43927 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CXCL13O43927 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CXCL13O43927 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CXCL13O43927 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CXCL13O43927 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CXCL13O43927 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CXCL13O43927 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CXCL13O43927 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CXCL13O43927 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CXCL13O43927 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CXCL13O43927 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CXCL13O43927 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CXCL13O43927 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CXCL13O43927 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CXCL13O43927 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CXCL13O43927 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CXCL13O43927 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CXCL13O43927 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CXCL13O43927 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CXCL13O43927 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CXCL13O43927 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CXCL13O43927 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CXCL13O43927 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CXCL13O43927 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CXCL13O43927 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CXCL13O43927 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CXCL13O43927 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CXCL13O43927 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CXCL13O43927 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CXCL13O43927 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CXCL13O43927 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CXCL13O43927 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CXCL13O43927 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CXCL13O43927 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CXCL13O43927 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CXCL13O43927 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CXCL13O43927 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CXCL13O43927 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CXCL13O43927 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CXCL13O43927 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CXCL13O43927 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CXCL13O43927 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CXCL13O43927 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CXCL13O43927 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CXCL13O43927 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CXCL13O43927 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CXCL13O43927 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CXCL13O43927 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CXCL13O43927 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CXCL13O43927 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CXCL13O43927 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CXCL13O43927 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CXCL13O43927 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CXCL13O43927 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CXCL13O43927 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CXCL13O43927 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CXCL13O43927 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CXCL13O43927 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CXCL13O43927 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CXCL13O43927 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CXCL13O43927 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CXCL13O43927 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CXCL13O43927 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CXCL13O43927 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CXCL13O43927 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms