Protein–RNA interactions for Protein: O15335

CHAD, Chondroadherin, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHADO15335 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHADO15335 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHADO15335 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHADO15335 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHADO15335 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHADO15335 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHADO15335 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHADO15335 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHADO15335 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHADO15335 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHADO15335 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHADO15335 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHADO15335 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHADO15335 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHADO15335 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHADO15335 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHADO15335 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHADO15335 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHADO15335 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHADO15335 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHADO15335 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHADO15335 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CHADO15335 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CHADO15335 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHADO15335 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHADO15335 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CHADO15335 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CHADO15335 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHADO15335 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CHADO15335 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHADO15335 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CHADO15335 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHADO15335 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHADO15335 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHADO15335 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHADO15335 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHADO15335 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CHADO15335 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHADO15335 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHADO15335 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHADO15335 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHADO15335 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHADO15335 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHADO15335 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHADO15335 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CHADO15335 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHADO15335 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHADO15335 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHADO15335 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHADO15335 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHADO15335 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHADO15335 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHADO15335 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHADO15335 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHADO15335 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHADO15335 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHADO15335 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHADO15335 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHADO15335 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHADO15335 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHADO15335 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHADO15335 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHADO15335 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CHADO15335 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHADO15335 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHADO15335 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHADO15335 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHADO15335 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHADO15335 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHADO15335 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CHADO15335 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHADO15335 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHADO15335 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHADO15335 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHADO15335 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHADO15335 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHADO15335 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHADO15335 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CHADO15335 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHADO15335 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHADO15335 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHADO15335 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHADO15335 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHADO15335 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHADO15335 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHADO15335 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHADO15335 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHADO15335 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHADO15335 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHADO15335 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHADO15335 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHADO15335 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHADO15335 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
CHADO15335 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHADO15335 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHADO15335 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHADO15335 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHADO15335 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHADO15335 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHADO15335 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155.2 ms