Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HMGB1P1B2RPK0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HMGB1P1B2RPK0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HMGB1P1B2RPK0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HMGB1P1B2RPK0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HMGB1P1B2RPK0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HMGB1P1B2RPK0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
HMGB1P1B2RPK0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
HMGB1P1B2RPK0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
HMGB1P1B2RPK0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HMGB1P1B2RPK0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HMGB1P1B2RPK0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HMGB1P1B2RPK0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HMGB1P1B2RPK0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HMGB1P1B2RPK0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HMGB1P1B2RPK0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HMGB1P1B2RPK0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HMGB1P1B2RPK0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HMGB1P1B2RPK0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HMGB1P1B2RPK0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HMGB1P1B2RPK0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HMGB1P1B2RPK0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HMGB1P1B2RPK0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HMGB1P1B2RPK0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HMGB1P1B2RPK0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HMGB1P1B2RPK0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HMGB1P1B2RPK0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HMGB1P1B2RPK0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HMGB1P1B2RPK0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HMGB1P1B2RPK0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HMGB1P1B2RPK0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HMGB1P1B2RPK0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HMGB1P1B2RPK0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HMGB1P1B2RPK0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HMGB1P1B2RPK0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HMGB1P1B2RPK0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HMGB1P1B2RPK0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HMGB1P1B2RPK0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HMGB1P1B2RPK0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HMGB1P1B2RPK0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HMGB1P1B2RPK0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HMGB1P1B2RPK0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HMGB1P1B2RPK0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HMGB1P1B2RPK0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HMGB1P1B2RPK0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HMGB1P1B2RPK0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HMGB1P1B2RPK0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HMGB1P1B2RPK0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HMGB1P1B2RPK0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HMGB1P1B2RPK0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HMGB1P1B2RPK0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HMGB1P1B2RPK0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HMGB1P1B2RPK0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HMGB1P1B2RPK0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HMGB1P1B2RPK0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HMGB1P1B2RPK0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HMGB1P1B2RPK0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HMGB1P1B2RPK0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HMGB1P1B2RPK0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HMGB1P1B2RPK0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HMGB1P1B2RPK0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HMGB1P1B2RPK0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HMGB1P1B2RPK0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HMGB1P1B2RPK0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HMGB1P1B2RPK0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HMGB1P1B2RPK0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HMGB1P1B2RPK0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HMGB1P1B2RPK0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HMGB1P1B2RPK0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HMGB1P1B2RPK0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HMGB1P1B2RPK0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HMGB1P1B2RPK0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HMGB1P1B2RPK0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HMGB1P1B2RPK0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HMGB1P1B2RPK0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HMGB1P1B2RPK0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HMGB1P1B2RPK0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HMGB1P1B2RPK0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HMGB1P1B2RPK0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HMGB1P1B2RPK0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HMGB1P1B2RPK0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HMGB1P1B2RPK0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HMGB1P1B2RPK0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HMGB1P1B2RPK0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HMGB1P1B2RPK0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HMGB1P1B2RPK0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HMGB1P1B2RPK0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HMGB1P1B2RPK0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HMGB1P1B2RPK0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HMGB1P1B2RPK0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HMGB1P1B2RPK0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HMGB1P1B2RPK0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HMGB1P1B2RPK0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HMGB1P1B2RPK0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HMGB1P1B2RPK0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HMGB1P1B2RPK0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HMGB1P1B2RPK0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HMGB1P1B2RPK0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HMGB1P1B2RPK0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HMGB1P1B2RPK0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms