Protein–RNA interactions for Protein: A6NIZ1

Ras-related protein Rap-1b-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NIZ1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
A6NIZ1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
A6NIZ1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
A6NIZ1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
A6NIZ1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
A6NIZ1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
A6NIZ1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
A6NIZ1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
A6NIZ1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
A6NIZ1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
A6NIZ1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
A6NIZ1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
A6NIZ1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
A6NIZ1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
A6NIZ1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
A6NIZ1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
A6NIZ1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
A6NIZ1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A6NIZ1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A6NIZ1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
A6NIZ1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
A6NIZ1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
A6NIZ1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A6NIZ1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A6NIZ1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
A6NIZ1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A6NIZ1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
A6NIZ1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
A6NIZ1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
A6NIZ1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
A6NIZ1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
A6NIZ1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
A6NIZ1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
A6NIZ1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
A6NIZ1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
A6NIZ1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
A6NIZ1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
A6NIZ1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
A6NIZ1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
A6NIZ1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
A6NIZ1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
A6NIZ1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
A6NIZ1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
A6NIZ1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
A6NIZ1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
A6NIZ1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
A6NIZ1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
A6NIZ1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
A6NIZ1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
A6NIZ1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
A6NIZ1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
A6NIZ1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
A6NIZ1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
A6NIZ1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
A6NIZ1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
A6NIZ1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
A6NIZ1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
A6NIZ1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
A6NIZ1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
A6NIZ1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
A6NIZ1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
A6NIZ1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
A6NIZ1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
A6NIZ1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
A6NIZ1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
A6NIZ1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
A6NIZ1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
A6NIZ1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
A6NIZ1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
A6NIZ1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
A6NIZ1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
A6NIZ1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
A6NIZ1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
A6NIZ1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
A6NIZ1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
A6NIZ1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
A6NIZ1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
A6NIZ1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
A6NIZ1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
A6NIZ1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
A6NIZ1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
A6NIZ1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
A6NIZ1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
A6NIZ1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
A6NIZ1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
A6NIZ1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
A6NIZ1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
A6NIZ1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
A6NIZ1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
A6NIZ1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
A6NIZ1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
A6NIZ1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
A6NIZ1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
A6NIZ1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
A6NIZ1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
A6NIZ1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
A6NIZ1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
A6NIZ1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
A6NIZ1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
A6NIZ1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms