Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUR7

ANKRD20A3, Ankyrin repeat domain-containing protein 20A3, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD20A3Q5VUR7 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD20A3Q5VUR7 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD20A3Q5VUR7 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD20A3Q5VUR7 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD20A3Q5VUR7 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD20A3Q5VUR7 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD20A3Q5VUR7 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD20A3Q5VUR7 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD20A3Q5VUR7 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD20A3Q5VUR7 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD20A3Q5VUR7 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD20A3Q5VUR7 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD20A3Q5VUR7 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD20A3Q5VUR7 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD20A3Q5VUR7 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD20A3Q5VUR7 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD20A3Q5VUR7 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD20A3Q5VUR7 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD20A3Q5VUR7 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD20A3Q5VUR7 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD20A3Q5VUR7 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD20A3Q5VUR7 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD20A3Q5VUR7 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD20A3Q5VUR7 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD20A3Q5VUR7 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD20A3Q5VUR7 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD20A3Q5VUR7 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD20A3Q5VUR7 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD20A3Q5VUR7 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD20A3Q5VUR7 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD20A3Q5VUR7 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD20A3Q5VUR7 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD20A3Q5VUR7 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD20A3Q5VUR7 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD20A3Q5VUR7 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD20A3Q5VUR7 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD20A3Q5VUR7 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD20A3Q5VUR7 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD20A3Q5VUR7 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD20A3Q5VUR7 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD20A3Q5VUR7 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD20A3Q5VUR7 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD20A3Q5VUR7 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ANKRD20A3Q5VUR7 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ANKRD20A3Q5VUR7 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ANKRD20A3Q5VUR7 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ANKRD20A3Q5VUR7 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ANKRD20A3Q5VUR7 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ANKRD20A3Q5VUR7 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ANKRD20A3Q5VUR7 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ANKRD20A3Q5VUR7 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ANKRD20A3Q5VUR7 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ANKRD20A3Q5VUR7 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ANKRD20A3Q5VUR7 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ANKRD20A3Q5VUR7 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ANKRD20A3Q5VUR7 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ANKRD20A3Q5VUR7 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ANKRD20A3Q5VUR7 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ANKRD20A3Q5VUR7 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ANKRD20A3Q5VUR7 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ANKRD20A3Q5VUR7 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ANKRD20A3Q5VUR7 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ANKRD20A3Q5VUR7 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ANKRD20A3Q5VUR7 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ANKRD20A3Q5VUR7 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ANKRD20A3Q5VUR7 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ANKRD20A3Q5VUR7 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ANKRD20A3Q5VUR7 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ANKRD20A3Q5VUR7 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ANKRD20A3Q5VUR7 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ANKRD20A3Q5VUR7 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ANKRD20A3Q5VUR7 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ANKRD20A3Q5VUR7 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ANKRD20A3Q5VUR7 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ANKRD20A3Q5VUR7 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ANKRD20A3Q5VUR7 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ANKRD20A3Q5VUR7 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD20A3Q5VUR7 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD20A3Q5VUR7 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD20A3Q5VUR7 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD20A3Q5VUR7 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD20A3Q5VUR7 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD20A3Q5VUR7 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD20A3Q5VUR7 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD20A3Q5VUR7 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD20A3Q5VUR7 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD20A3Q5VUR7 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD20A3Q5VUR7 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD20A3Q5VUR7 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD20A3Q5VUR7 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD20A3Q5VUR7 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD20A3Q5VUR7 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD20A3Q5VUR7 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD20A3Q5VUR7 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD20A3Q5VUR7 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD20A3Q5VUR7 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD20A3Q5VUR7 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD20A3Q5VUR7 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD20A3Q5VUR7 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD20A3Q5VUR7 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms