Protein–RNA interactions for Protein: P53992

SEC24C, Protein transport protein Sec24C, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24CP53992 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SEC24CP53992 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114 ms