RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000268661.7

RPL3L-201, Transcript of ribosomal protein L3 like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RPL3L, Length 2,182 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL3L-201ENST00000268661 NISCHQ9Y2I1 1504 aa32.82■■■□□ 2.84
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RPL3L-201ENST00000268661 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.84■■■□□ 2.05
RPL3L-201ENST00000268661 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa27.76■■■□□ 2.03
RPL3L-201ENST00000268661 MYO15BQ96JP2 1530 aa27.51■■■□□ 2
RPL3L-201ENST00000268661 HRCP23327 699 aa27.49■■□□□ 1.99
RPL3L-201ENST00000268661 CHIC1Q5VXU3 224 aa27.43■■□□□ 1.98
RPL3L-201ENST00000268661 PCGF6Q9BYE7 350 aa27.02■■□□□ 1.92
RPL3L-201ENST00000268661 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa27■■□□□ 1.91
RPL3L-201ENST00000268661 DCAF8L2P0C7V8 631 aa26.79■■□□□ 1.88
RPL3L-201ENST00000268661 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
RPL3L-201ENST00000268661 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa26.57■■□□□ 1.84
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RPL3L-201ENST00000268661 ABCC9O60706 1549 aa26.44■■□□□ 1.82
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RPL3L-201ENST00000268661 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.78
RPL3L-201ENST00000268661 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa25.99■■□□□ 1.75
RPL3L-201ENST00000268661 SCRIBQ14160 1630 aa25.98■■□□□ 1.75
RPL3L-201ENST00000268661 TRIM41Q8WV44 630 aa25.94■■□□□ 1.74
RPL3L-201ENST00000268661 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
RPL3L-201ENST00000268661 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP25.68■■□□□ 1.7
RPL3L-201ENST00000268661 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
RPL3L-201ENST00000268661 MROH2BQ7Z745 1585 aa25.52■■□□□ 1.68
RPL3L-201ENST00000268661 CECR2Q9BXF3 1484 aa25.51■■□□□ 1.67
RPL3L-201ENST00000268661 NACADO15069 1562 aa25.48■■□□□ 1.67
RPL3L-201ENST00000268661 WIZO95785 1651 aa25.43■■□□□ 1.66
RPL3L-201ENST00000268661 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
RPL3L-201ENST00000268661 EHMT2Q96KQ7 1210 aa25.37■■□□□ 1.65
RPL3L-201ENST00000268661 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
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RPL3L-201ENST00000268661 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
RPL3L-201ENST00000268661 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
RPL3L-201ENST00000268661 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.2■■□□□ 1.62
RPL3L-201ENST00000268661 NEUROD1Q13562 356 aa25.11■■□□□ 1.61
RPL3L-201ENST00000268661 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
RPL3L-201ENST00000268661 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
RPL3L-201ENST00000268661 ABCC8Q09428 1581 aa25.01■■□□□ 1.59
RPL3L-201ENST00000268661 CEP162Q5TB80 1403 aa25■■□□□ 1.59
RPL3L-201ENST00000268661 CCDC88BA6NC98 1476 aa25■■□□□ 1.59
RPL3L-201ENST00000268661 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
RPL3L-201ENST00000268661 TNIKQ9UKE5 1360 aa24.95■■□□□ 1.58
RPL3L-201ENST00000268661 SMARCA2P51531 1590 aa24.94■■□□□ 1.58
RPL3L-201ENST00000268661 SMARCA4P51532 1647 aa24.92■■□□□ 1.58
RPL3L-201ENST00000268661 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa24.89■■□□□ 1.58
RPL3L-201ENST00000268661 EEA1Q15075 1411 aa24.89■■□□□ 1.57
RPL3L-201ENST00000268661 SOGA1O94964 1423 aa24.85■■□□□ 1.57
RPL3L-201ENST00000268661 UNC13AQ9UPW8 1703 aa24.81■■□□□ 1.56
RPL3L-201ENST00000268661 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
RPL3L-201ENST00000268661 CSRNP3Q8WYN3 585 aa24.73■■□□□ 1.55
RPL3L-201ENST00000268661 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
RPL3L-201ENST00000268661 GOLGA3Q08378 1498 aa24.72■■□□□ 1.55
RPL3L-201ENST00000268661 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa24.71■■□□□ 1.55
RPL3L-201ENST00000268661 MYT1Q01538 1121 aa24.66■■□□□ 1.54
RPL3L-201ENST00000268661 BICRAQ9NZM4 1560 aa24.62■■□□□ 1.53
RPL3L-201ENST00000268661 UBTFP17480 764 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
RPL3L-201ENST00000268661 KIF21BO75037 1637 aa24.58■■□□□ 1.52
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RPL3L-201ENST00000268661 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.53■■□□□ 1.52
RPL3L-201ENST00000268661 PEG3Q9GZU2 1588 aa24.46■■□□□ 1.51
RPL3L-201ENST00000268661 SYNJ1O43426 1573 aa24.43■■□□□ 1.5
RPL3L-201ENST00000268661 MIER1Q8N108 512 aa24.43■■□□□ 1.5
RPL3L-201ENST00000268661 CLIP1P30622 1438 aa24.42■■□□□ 1.5
RPL3L-201ENST00000268661 VPS8Q8N3P4 1428 aa24.42■■□□□ 1.5
RPL3L-201ENST00000268661 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
RPL3L-201ENST00000268661 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
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RPL3L-201ENST00000268661 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
RPL3L-201ENST00000268661 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa24.24■■□□□ 1.47
RPL3L-201ENST00000268661 CLSPNQ9HAW4 1339 aa24.22■■□□□ 1.47
RPL3L-201ENST00000268661 APLP2Q06481 763 aa24.18■■□□□ 1.46
RPL3L-201ENST00000268661 TOP2BQ02880 1626 aa24.12■■□□□ 1.45
RPL3L-201ENST00000268661 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
RPL3L-201ENST00000268661 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa24.1■■□□□ 1.45
RPL3L-201ENST00000268661 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.08■■□□□ 1.45
RPL3L-201ENST00000268661 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.06■■□□□ 1.44
RPL3L-201ENST00000268661 ARAP1Q96P48 1450 aa24.01■■□□□ 1.43
RPL3L-201ENST00000268661 PRXQ9BXM0 1461 aa24■■□□□ 1.43
RPL3L-201ENST00000268661 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
RPL3L-201ENST00000268661 CUX2O14529 1486 aa23.96■■□□□ 1.43
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RPL3L-201ENST00000268661 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.89■■□□□ 1.41
RPL3L-201ENST00000268661 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
RPL3L-201ENST00000268661 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
RPL3L-201ENST00000268661 CCNB3Q8WWL7 1395 aa23.76■■□□□ 1.39
RPL3L-201ENST00000268661 CUX1P39880 1505 aa23.74■■□□□ 1.39
RPL3L-201ENST00000268661 KIF27Q86VH2 1401 aa23.71■■□□□ 1.39
RPL3L-201ENST00000268661 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa23.71■■□□□ 1.39
RPL3L-201ENST00000268661 MAPKBP1O60336 1514 aa23.67■■□□□ 1.38
RPL3L-201ENST00000268661 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa23.65■■□□□ 1.38
RPL3L-201ENST00000268661 HMGXB3Q12766 1538 aa23.64■■□□□ 1.37
RPL3L-201ENST00000268661 MAP3K1Q13233 1512 aa23.63■■□□□ 1.37
RPL3L-201ENST00000268661 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa23.6■■□□□ 1.37
RPL3L-201ENST00000268661 TIAM1Q13009 1591 aa23.58■■□□□ 1.37
RPL3L-201ENST00000268661 NCAPD3P42695 1498 aa23.56■■□□□ 1.36
RPL3L-201ENST00000268661 CFTRP13569 1480 aa23.52■■□□□ 1.36
RPL3L-201ENST00000268661 KCNH8Q96L42 1107 aa23.51■■□□□ 1.35
RPL3L-201ENST00000268661 SETD5Q9C0A6 1442 aa23.5■■□□□ 1.35
RPL3L-201ENST00000268661 PRDM2Q13029 1718 aa23.49■■□□□ 1.35
RPL3L-201ENST00000268661 WDR97A6NE52 1622 aa23.48■■□□□ 1.35
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