Protein–RNA interactions for Protein: O14618

CCS, Copper chaperone for superoxide dismutase, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSO14618 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CCSO14618 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCSO14618 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCSO14618 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCSO14618 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCSO14618 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCSO14618 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCSO14618 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCSO14618 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCSO14618 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCSO14618 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCSO14618 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCSO14618 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCSO14618 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCSO14618 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCSO14618 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCSO14618 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCSO14618 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCSO14618 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCSO14618 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCSO14618 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCSO14618 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCSO14618 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCSO14618 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCSO14618 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CCSO14618 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCSO14618 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCSO14618 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCSO14618 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCSO14618 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCSO14618 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCSO14618 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CCSO14618 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCSO14618 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCSO14618 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CCSO14618 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CCSO14618 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCSO14618 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCSO14618 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCSO14618 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCSO14618 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCSO14618 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CCSO14618 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CCSO14618 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCSO14618 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCSO14618 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCSO14618 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CCSO14618 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCSO14618 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCSO14618 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCSO14618 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCSO14618 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCSO14618 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCSO14618 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCSO14618 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCSO14618 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCSO14618 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CCSO14618 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CCSO14618 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCSO14618 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCSO14618 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCSO14618 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CCSO14618 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCSO14618 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CCSO14618 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CCSO14618 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCSO14618 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCSO14618 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCSO14618 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCSO14618 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCSO14618 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CCSO14618 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCSO14618 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCSO14618 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CCSO14618 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCSO14618 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCSO14618 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCSO14618 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CCSO14618 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CCSO14618 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CCSO14618 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CCSO14618 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CCSO14618 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CCSO14618 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
CCSO14618 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CCSO14618 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
CCSO14618 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CCSO14618 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CCSO14618 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCSO14618 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CCSO14618 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCSO14618 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CCSO14618 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CCSO14618 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCSO14618 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCSO14618 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCSO14618 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCSO14618 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCSO14618 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCSO14618 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms