RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524304.1

HOXA-AS3-205, HOXA cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXA-AS3, Length 2,063 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA-AS3-205ENST00000524304 NISCHQ9Y2I1 1504 aa39.94■■■■□ 3.98
HOXA-AS3-205ENST00000524304 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa34.68■■■■□ 3.14
HOXA-AS3-205ENST00000524304 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP33.57■■■□□ 2.97
HOXA-AS3-205ENST00000524304 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa33■■■□□ 2.87
HOXA-AS3-205ENST00000524304 DCAF8L2P0C7V8 631 aa32.98■■■□□ 2.87
HOXA-AS3-205ENST00000524304 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa32.76■■■□□ 2.84
HOXA-AS3-205ENST00000524304 ABCC9O60706 1549 aa32.69■■■□□ 2.82
HOXA-AS3-205ENST00000524304 MYO15BQ96JP2 1530 aa32.52■■■□□ 2.8
HOXA-AS3-205ENST00000524304 NACADO15069 1562 aa32.28■■■□□ 2.76
HOXA-AS3-205ENST00000524304 SCRIBQ14160 1630 aa31.96■■■□□ 2.71
HOXA-AS3-205ENST00000524304 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31.95■■■□□ 2.71
HOXA-AS3-205ENST00000524304 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP31.63■■■□□ 2.65
HOXA-AS3-205ENST00000524304 UNC13AQ9UPW8 1703 aa31.33■■■□□ 2.61
HOXA-AS3-205ENST00000524304 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.08■■■□□ 2.57
HOXA-AS3-205ENST00000524304 CECR2Q9BXF3 1484 aa31.05■■■□□ 2.56
HOXA-AS3-205ENST00000524304 BICRAQ9NZM4 1560 aa31.02■■■□□ 2.56
HOXA-AS3-205ENST00000524304 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP30.91■■■□□ 2.54
HOXA-AS3-205ENST00000524304 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.88■■■□□ 2.53
HOXA-AS3-205ENST00000524304 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP30.8■■■□□ 2.52
HOXA-AS3-205ENST00000524304 SMARCA4P51532 1647 aa30.64■■■□□ 2.5
HOXA-AS3-205ENST00000524304 WIZO95785 1651 aa30.63■■■□□ 2.49
HOXA-AS3-205ENST00000524304 CHIC1Q5VXU3 224 aa30.39■■■□□ 2.46
HOXA-AS3-205ENST00000524304 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP30.29■■■□□ 2.44
HOXA-AS3-205ENST00000524304 PEG3Q9GZU2 1588 aa30.26■■■□□ 2.43
HOXA-AS3-205ENST00000524304 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30.12■■■□□ 2.41
HOXA-AS3-205ENST00000524304 SMARCA2P51531 1590 aa30.07■■■□□ 2.4
HOXA-AS3-205ENST00000524304 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP30.05■■■□□ 2.4
HOXA-AS3-205ENST00000524304 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.03■■■□□ 2.4
HOXA-AS3-205ENST00000524304 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP29.94■■■□□ 2.38
HOXA-AS3-205ENST00000524304 NCAPD3P42695 1498 aa29.82■■■□□ 2.36
HOXA-AS3-205ENST00000524304 HMGXB3Q12766 1538 aa29.76■■■□□ 2.35
HOXA-AS3-205ENST00000524304 TRIM41Q8WV44 630 aa29.71■■■□□ 2.35
HOXA-AS3-205ENST00000524304 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa29.57■■■□□ 2.32
HOXA-AS3-205ENST00000524304 ABCC8Q09428 1581 aa29.45■■■□□ 2.31
HOXA-AS3-205ENST00000524304 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa29.26■■■□□ 2.27
HOXA-AS3-205ENST00000524304 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.23■■■□□ 2.27
HOXA-AS3-205ENST00000524304 CFTRP13569 1480 aa29.21■■■□□ 2.27
HOXA-AS3-205ENST00000524304 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP29.19■■■□□ 2.26
HOXA-AS3-205ENST00000524304 SYNJ1O43426 1573 aa29.1■■■□□ 2.25
HOXA-AS3-205ENST00000524304 CADPSQ9ULU8 1353 aa29.08■■■□□ 2.25
HOXA-AS3-205ENST00000524304 PRDM2Q13029 1718 aa29.02■■■□□ 2.24
HOXA-AS3-205ENST00000524304 SOGA1O94964 1423 aa28.96■■■□□ 2.23
HOXA-AS3-205ENST00000524304 TOP2BQ02880 1626 aa28.96■■■□□ 2.23
HOXA-AS3-205ENST00000524304 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.91■■■□□ 2.22
HOXA-AS3-205ENST00000524304 EEA1Q15075 1411 aa28.9■■■□□ 2.22
HOXA-AS3-205ENST00000524304 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa28.86■■■□□ 2.21
HOXA-AS3-205ENST00000524304 CUX1P39880 1505 aa28.85■■■□□ 2.21
HOXA-AS3-205ENST00000524304 DNAJC5BQ9UF47 199 aa28.84■■■□□ 2.21
HOXA-AS3-205ENST00000524304 EHMT2Q96KQ7 1210 aa28.79■■■□□ 2.2
HOXA-AS3-205ENST00000524304 CSRNP3Q8WYN3 585 aa28.78■■■□□ 2.2
HOXA-AS3-205ENST00000524304 NESP48681 1621 aa28.77■■■□□ 2.2
HOXA-AS3-205ENST00000524304 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.75■■■□□ 2.19
HOXA-AS3-205ENST00000524304 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.75■■■□□ 2.19
HOXA-AS3-205ENST00000524304 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.53■■■□□ 2.16
HOXA-AS3-205ENST00000524304 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.53■■■□□ 2.16
HOXA-AS3-205ENST00000524304 GOLGA3Q08378 1498 aa28.51■■■□□ 2.15
HOXA-AS3-205ENST00000524304 KIF21BO75037 1637 aa28.51■■■□□ 2.15
HOXA-AS3-205ENST00000524304 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.51■■■□□ 2.15
HOXA-AS3-205ENST00000524304 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.5■■■□□ 2.15
HOXA-AS3-205ENST00000524304 TNIKQ9UKE5 1360 aa28.49■■■□□ 2.15
HOXA-AS3-205ENST00000524304 KIF27Q86VH2 1401 aa28.47■■■□□ 2.15
HOXA-AS3-205ENST00000524304 TOPBP1Q92547 1522 aa28.46■■■□□ 2.15
HOXA-AS3-205ENST00000524304 UBTFP17480 764 aaKnown RBP28.42■■■□□ 2.14
HOXA-AS3-205ENST00000524304 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP28.39■■■□□ 2.14
HOXA-AS3-205ENST00000524304 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.39■■■□□ 2.13
HOXA-AS3-205ENST00000524304 CUX2O14529 1486 aa28.36■■■□□ 2.13
HOXA-AS3-205ENST00000524304 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa28.35■■■□□ 2.13
HOXA-AS3-205ENST00000524304 PRXQ9BXM0 1461 aa28.34■■■□□ 2.13
HOXA-AS3-205ENST00000524304 CEP162Q5TB80 1403 aa28.34■■■□□ 2.13
HOXA-AS3-205ENST00000524304 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
HOXA-AS3-205ENST00000524304 ERICH3Q5RHP9 1530 aa28.28■■■□□ 2.12
HOXA-AS3-205ENST00000524304 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.27■■■□□ 2.12
HOXA-AS3-205ENST00000524304 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.25■■■□□ 2.11
HOXA-AS3-205ENST00000524304 IGF1RP08069 1367 aa28.23■■■□□ 2.11
HOXA-AS3-205ENST00000524304 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.15■■■□□ 2.1
HOXA-AS3-205ENST00000524304 WDR97A6NE52 1622 aa28.11■■■□□ 2.09
HOXA-AS3-205ENST00000524304 PCGF6Q9BYE7 350 aa28.1■■■□□ 2.09
HOXA-AS3-205ENST00000524304 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa28.08■■■□□ 2.09
HOXA-AS3-205ENST00000524304 CLIP1P30622 1438 aa28.08■■■□□ 2.09
HOXA-AS3-205ENST00000524304 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
HOXA-AS3-205ENST00000524304 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP28.01■■■□□ 2.07
HOXA-AS3-205ENST00000524304 WDR62O43379 1518 aa27.99■■■□□ 2.07
HOXA-AS3-205ENST00000524304 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
HOXA-AS3-205ENST00000524304 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.99■■■□□ 2.07
HOXA-AS3-205ENST00000524304 ERCC6Q03468 1493 aa27.98■■■□□ 2.07
HOXA-AS3-205ENST00000524304 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.94■■■□□ 2.06
HOXA-AS3-205ENST00000524304 CUL7Q14999 1698 aa27.93■■■□□ 2.06
HOXA-AS3-205ENST00000524304 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP27.91■■■□□ 2.06
HOXA-AS3-205ENST00000524304 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP27.87■■■□□ 2.05
HOXA-AS3-205ENST00000524304 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.86■■■□□ 2.05
HOXA-AS3-205ENST00000524304 VPS8Q8N3P4 1428 aa27.86■■■□□ 2.05
HOXA-AS3-205ENST00000524304 IFT140Q96RY7 1462 aa27.84■■■□□ 2.05
HOXA-AS3-205ENST00000524304 ARAP1Q96P48 1450 aa27.78■■■□□ 2.04
HOXA-AS3-205ENST00000524304 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.77■■■□□ 2.04
HOXA-AS3-205ENST00000524304 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa27.75■■■□□ 2.03
HOXA-AS3-205ENST00000524304 PBRM1Q86U86 1689 aa27.74■■■□□ 2.03
HOXA-AS3-205ENST00000524304 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27.71■■■□□ 2.03
HOXA-AS3-205ENST00000524304 GRIN2BQ13224 1484 aa27.68■■■□□ 2.02
HOXA-AS3-205ENST00000524304 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa27.65■■■□□ 2.02
HOXA-AS3-205ENST00000524304 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.64■■■□□ 2.02
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