Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q4

HCN4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, humanhuman

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Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4Q9Y3Q4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HCN4Q9Y3Q4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HCN4Q9Y3Q4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HCN4Q9Y3Q4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HCN4Q9Y3Q4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HCN4Q9Y3Q4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HCN4Q9Y3Q4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HCN4Q9Y3Q4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HCN4Q9Y3Q4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HCN4Q9Y3Q4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HCN4Q9Y3Q4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HCN4Q9Y3Q4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HCN4Q9Y3Q4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HCN4Q9Y3Q4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HCN4Q9Y3Q4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HCN4Q9Y3Q4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HCN4Q9Y3Q4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HCN4Q9Y3Q4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
HCN4Q9Y3Q4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
HCN4Q9Y3Q4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
HCN4Q9Y3Q4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
HCN4Q9Y3Q4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HCN4Q9Y3Q4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HCN4Q9Y3Q4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HCN4Q9Y3Q4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HCN4Q9Y3Q4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HCN4Q9Y3Q4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
HCN4Q9Y3Q4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HCN4Q9Y3Q4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HCN4Q9Y3Q4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
HCN4Q9Y3Q4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HCN4Q9Y3Q4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HCN4Q9Y3Q4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HCN4Q9Y3Q4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HCN4Q9Y3Q4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HCN4Q9Y3Q4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HCN4Q9Y3Q4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HCN4Q9Y3Q4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HCN4Q9Y3Q4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HCN4Q9Y3Q4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HCN4Q9Y3Q4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HCN4Q9Y3Q4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HCN4Q9Y3Q4 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HCN4Q9Y3Q4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HCN4Q9Y3Q4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HCN4Q9Y3Q4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HCN4Q9Y3Q4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HCN4Q9Y3Q4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HCN4Q9Y3Q4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HCN4Q9Y3Q4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HCN4Q9Y3Q4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HCN4Q9Y3Q4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HCN4Q9Y3Q4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HCN4Q9Y3Q4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
HCN4Q9Y3Q4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HCN4Q9Y3Q4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HCN4Q9Y3Q4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HCN4Q9Y3Q4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HCN4Q9Y3Q4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HCN4Q9Y3Q4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HCN4Q9Y3Q4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HCN4Q9Y3Q4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HCN4Q9Y3Q4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
HCN4Q9Y3Q4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
HCN4Q9Y3Q4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
HCN4Q9Y3Q4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HCN4Q9Y3Q4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HCN4Q9Y3Q4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
HCN4Q9Y3Q4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
HCN4Q9Y3Q4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HCN4Q9Y3Q4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HCN4Q9Y3Q4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HCN4Q9Y3Q4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
HCN4Q9Y3Q4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HCN4Q9Y3Q4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HCN4Q9Y3Q4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HCN4Q9Y3Q4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HCN4Q9Y3Q4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HCN4Q9Y3Q4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HCN4Q9Y3Q4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HCN4Q9Y3Q4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HCN4Q9Y3Q4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HCN4Q9Y3Q4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HCN4Q9Y3Q4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HCN4Q9Y3Q4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HCN4Q9Y3Q4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HCN4Q9Y3Q4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HCN4Q9Y3Q4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HCN4Q9Y3Q4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HCN4Q9Y3Q4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HCN4Q9Y3Q4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
HCN4Q9Y3Q4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HCN4Q9Y3Q4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HCN4Q9Y3Q4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
HCN4Q9Y3Q4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HCN4Q9Y3Q4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HCN4Q9Y3Q4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HCN4Q9Y3Q4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HCN4Q9Y3Q4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HCN4Q9Y3Q4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
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