Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W0

IFNK, Interferon kappa, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNKQ9P0W0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
IFNKQ9P0W0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
IFNKQ9P0W0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
IFNKQ9P0W0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
IFNKQ9P0W0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
IFNKQ9P0W0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
IFNKQ9P0W0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
IFNKQ9P0W0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
IFNKQ9P0W0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
IFNKQ9P0W0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
IFNKQ9P0W0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
IFNKQ9P0W0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
IFNKQ9P0W0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
IFNKQ9P0W0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
IFNKQ9P0W0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
IFNKQ9P0W0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
IFNKQ9P0W0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
IFNKQ9P0W0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
IFNKQ9P0W0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
IFNKQ9P0W0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
IFNKQ9P0W0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
IFNKQ9P0W0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
IFNKQ9P0W0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
IFNKQ9P0W0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
IFNKQ9P0W0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
IFNKQ9P0W0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
IFNKQ9P0W0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
IFNKQ9P0W0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
IFNKQ9P0W0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
IFNKQ9P0W0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
IFNKQ9P0W0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
IFNKQ9P0W0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
IFNKQ9P0W0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
IFNKQ9P0W0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
IFNKQ9P0W0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
IFNKQ9P0W0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
IFNKQ9P0W0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
IFNKQ9P0W0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
IFNKQ9P0W0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
IFNKQ9P0W0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
IFNKQ9P0W0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
IFNKQ9P0W0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
IFNKQ9P0W0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
IFNKQ9P0W0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
IFNKQ9P0W0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
IFNKQ9P0W0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
IFNKQ9P0W0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
IFNKQ9P0W0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
IFNKQ9P0W0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
IFNKQ9P0W0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
IFNKQ9P0W0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
IFNKQ9P0W0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
IFNKQ9P0W0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
IFNKQ9P0W0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
IFNKQ9P0W0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
IFNKQ9P0W0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
IFNKQ9P0W0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
IFNKQ9P0W0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
IFNKQ9P0W0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
IFNKQ9P0W0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
IFNKQ9P0W0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
IFNKQ9P0W0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
IFNKQ9P0W0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
IFNKQ9P0W0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
IFNKQ9P0W0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
IFNKQ9P0W0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
IFNKQ9P0W0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
IFNKQ9P0W0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
IFNKQ9P0W0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
IFNKQ9P0W0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
IFNKQ9P0W0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
IFNKQ9P0W0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
IFNKQ9P0W0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
IFNKQ9P0W0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
IFNKQ9P0W0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
IFNKQ9P0W0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
IFNKQ9P0W0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
IFNKQ9P0W0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
IFNKQ9P0W0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
IFNKQ9P0W0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
IFNKQ9P0W0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
IFNKQ9P0W0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
IFNKQ9P0W0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
IFNKQ9P0W0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
IFNKQ9P0W0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
IFNKQ9P0W0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
IFNKQ9P0W0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
IFNKQ9P0W0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
IFNKQ9P0W0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
IFNKQ9P0W0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
IFNKQ9P0W0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
IFNKQ9P0W0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
IFNKQ9P0W0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
IFNKQ9P0W0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
IFNKQ9P0W0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
IFNKQ9P0W0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
IFNKQ9P0W0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
IFNKQ9P0W0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
IFNKQ9P0W0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
IFNKQ9P0W0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 161.5 ms