Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZJ4

SACS, Sacsin, humanhuman

Predictions only

Length 4,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SACSQ9NZJ4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SACSQ9NZJ4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SACSQ9NZJ4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SACSQ9NZJ4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SACSQ9NZJ4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SACSQ9NZJ4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SACSQ9NZJ4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SACSQ9NZJ4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SACSQ9NZJ4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SACSQ9NZJ4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SACSQ9NZJ4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SACSQ9NZJ4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SACSQ9NZJ4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SACSQ9NZJ4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SACSQ9NZJ4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SACSQ9NZJ4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SACSQ9NZJ4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SACSQ9NZJ4 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SACSQ9NZJ4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SACSQ9NZJ4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
SACSQ9NZJ4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SACSQ9NZJ4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SACSQ9NZJ4 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SACSQ9NZJ4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SACSQ9NZJ4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SACSQ9NZJ4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SACSQ9NZJ4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SACSQ9NZJ4 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SACSQ9NZJ4 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SACSQ9NZJ4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SACSQ9NZJ4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SACSQ9NZJ4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SACSQ9NZJ4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SACSQ9NZJ4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SACSQ9NZJ4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SACSQ9NZJ4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SACSQ9NZJ4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SACSQ9NZJ4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SACSQ9NZJ4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SACSQ9NZJ4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SACSQ9NZJ4 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SACSQ9NZJ4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SACSQ9NZJ4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SACSQ9NZJ4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SACSQ9NZJ4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SACSQ9NZJ4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SACSQ9NZJ4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SACSQ9NZJ4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SACSQ9NZJ4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SACSQ9NZJ4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SACSQ9NZJ4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SACSQ9NZJ4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SACSQ9NZJ4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SACSQ9NZJ4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SACSQ9NZJ4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SACSQ9NZJ4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SACSQ9NZJ4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SACSQ9NZJ4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SACSQ9NZJ4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SACSQ9NZJ4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SACSQ9NZJ4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SACSQ9NZJ4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SACSQ9NZJ4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SACSQ9NZJ4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SACSQ9NZJ4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SACSQ9NZJ4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SACSQ9NZJ4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SACSQ9NZJ4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SACSQ9NZJ4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SACSQ9NZJ4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SACSQ9NZJ4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SACSQ9NZJ4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SACSQ9NZJ4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SACSQ9NZJ4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SACSQ9NZJ4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SACSQ9NZJ4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SACSQ9NZJ4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SACSQ9NZJ4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SACSQ9NZJ4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SACSQ9NZJ4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SACSQ9NZJ4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SACSQ9NZJ4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SACSQ9NZJ4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SACSQ9NZJ4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SACSQ9NZJ4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SACSQ9NZJ4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SACSQ9NZJ4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SACSQ9NZJ4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SACSQ9NZJ4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SACSQ9NZJ4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SACSQ9NZJ4 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SACSQ9NZJ4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SACSQ9NZJ4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SACSQ9NZJ4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SACSQ9NZJ4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SACSQ9NZJ4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SACSQ9NZJ4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SACSQ9NZJ4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SACSQ9NZJ4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SACSQ9NZJ4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms