Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXS0

COL25A1, Collagen alpha-1(XXV) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL25A1Q9BXS0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
COL25A1Q9BXS0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
COL25A1Q9BXS0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
COL25A1Q9BXS0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
COL25A1Q9BXS0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
COL25A1Q9BXS0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
COL25A1Q9BXS0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
COL25A1Q9BXS0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
COL25A1Q9BXS0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
COL25A1Q9BXS0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
COL25A1Q9BXS0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL25A1Q9BXS0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL25A1Q9BXS0 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL25A1Q9BXS0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL25A1Q9BXS0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL25A1Q9BXS0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
COL25A1Q9BXS0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
COL25A1Q9BXS0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
COL25A1Q9BXS0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
COL25A1Q9BXS0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
COL25A1Q9BXS0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
COL25A1Q9BXS0 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
COL25A1Q9BXS0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
COL25A1Q9BXS0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
COL25A1Q9BXS0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
COL25A1Q9BXS0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
COL25A1Q9BXS0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
COL25A1Q9BXS0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
COL25A1Q9BXS0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
COL25A1Q9BXS0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
COL25A1Q9BXS0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
COL25A1Q9BXS0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
COL25A1Q9BXS0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
COL25A1Q9BXS0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
COL25A1Q9BXS0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
COL25A1Q9BXS0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
COL25A1Q9BXS0 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
COL25A1Q9BXS0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
COL25A1Q9BXS0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
COL25A1Q9BXS0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
COL25A1Q9BXS0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
COL25A1Q9BXS0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
COL25A1Q9BXS0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
COL25A1Q9BXS0 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
COL25A1Q9BXS0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
COL25A1Q9BXS0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
COL25A1Q9BXS0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
COL25A1Q9BXS0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
COL25A1Q9BXS0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
COL25A1Q9BXS0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
COL25A1Q9BXS0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
COL25A1Q9BXS0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
COL25A1Q9BXS0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
COL25A1Q9BXS0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
COL25A1Q9BXS0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
COL25A1Q9BXS0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
COL25A1Q9BXS0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26■■□□□ 1.75
COL25A1Q9BXS0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26■■□□□ 1.75
COL25A1Q9BXS0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
COL25A1Q9BXS0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
COL25A1Q9BXS0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
COL25A1Q9BXS0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
COL25A1Q9BXS0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
COL25A1Q9BXS0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
COL25A1Q9BXS0 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
COL25A1Q9BXS0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
COL25A1Q9BXS0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
COL25A1Q9BXS0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
COL25A1Q9BXS0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
COL25A1Q9BXS0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
COL25A1Q9BXS0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
COL25A1Q9BXS0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
COL25A1Q9BXS0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
COL25A1Q9BXS0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
COL25A1Q9BXS0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
COL25A1Q9BXS0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
COL25A1Q9BXS0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
COL25A1Q9BXS0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
COL25A1Q9BXS0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
COL25A1Q9BXS0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
COL25A1Q9BXS0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
COL25A1Q9BXS0 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
COL25A1Q9BXS0 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
COL25A1Q9BXS0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
COL25A1Q9BXS0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
COL25A1Q9BXS0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
COL25A1Q9BXS0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
COL25A1Q9BXS0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
COL25A1Q9BXS0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
COL25A1Q9BXS0 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
COL25A1Q9BXS0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
COL25A1Q9BXS0 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
COL25A1Q9BXS0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
COL25A1Q9BXS0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
COL25A1Q9BXS0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
COL25A1Q9BXS0 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
COL25A1Q9BXS0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
COL25A1Q9BXS0 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
COL25A1Q9BXS0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
COL25A1Q9BXS0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 244.6 ms