Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GINS3Q9BRX5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GINS3Q9BRX5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GINS3Q9BRX5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GINS3Q9BRX5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GINS3Q9BRX5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GINS3Q9BRX5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GINS3Q9BRX5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GINS3Q9BRX5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GINS3Q9BRX5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GINS3Q9BRX5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
GINS3Q9BRX5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GINS3Q9BRX5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GINS3Q9BRX5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GINS3Q9BRX5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GINS3Q9BRX5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GINS3Q9BRX5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GINS3Q9BRX5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GINS3Q9BRX5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GINS3Q9BRX5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GINS3Q9BRX5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GINS3Q9BRX5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GINS3Q9BRX5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GINS3Q9BRX5 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GINS3Q9BRX5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GINS3Q9BRX5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GINS3Q9BRX5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GINS3Q9BRX5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GINS3Q9BRX5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GINS3Q9BRX5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GINS3Q9BRX5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GINS3Q9BRX5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GINS3Q9BRX5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
GINS3Q9BRX5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
GINS3Q9BRX5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GINS3Q9BRX5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GINS3Q9BRX5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GINS3Q9BRX5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GINS3Q9BRX5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GINS3Q9BRX5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GINS3Q9BRX5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GINS3Q9BRX5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GINS3Q9BRX5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GINS3Q9BRX5 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GINS3Q9BRX5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GINS3Q9BRX5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GINS3Q9BRX5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GINS3Q9BRX5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GINS3Q9BRX5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GINS3Q9BRX5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GINS3Q9BRX5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GINS3Q9BRX5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GINS3Q9BRX5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GINS3Q9BRX5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GINS3Q9BRX5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GINS3Q9BRX5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GINS3Q9BRX5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GINS3Q9BRX5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
GINS3Q9BRX5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
GINS3Q9BRX5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GINS3Q9BRX5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GINS3Q9BRX5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GINS3Q9BRX5 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GINS3Q9BRX5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GINS3Q9BRX5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GINS3Q9BRX5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GINS3Q9BRX5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GINS3Q9BRX5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GINS3Q9BRX5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GINS3Q9BRX5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GINS3Q9BRX5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GINS3Q9BRX5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GINS3Q9BRX5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GINS3Q9BRX5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GINS3Q9BRX5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GINS3Q9BRX5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GINS3Q9BRX5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GINS3Q9BRX5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GINS3Q9BRX5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GINS3Q9BRX5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GINS3Q9BRX5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GINS3Q9BRX5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GINS3Q9BRX5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GINS3Q9BRX5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GINS3Q9BRX5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GINS3Q9BRX5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GINS3Q9BRX5 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GINS3Q9BRX5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GINS3Q9BRX5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GINS3Q9BRX5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GINS3Q9BRX5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GINS3Q9BRX5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GINS3Q9BRX5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GINS3Q9BRX5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GINS3Q9BRX5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GINS3Q9BRX5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GINS3Q9BRX5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GINS3Q9BRX5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GINS3Q9BRX5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GINS3Q9BRX5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139 ms