Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK5

SDF4, 45 kDa calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDF4Q9BRK5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
SDF4Q9BRK5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SDF4Q9BRK5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SDF4Q9BRK5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SDF4Q9BRK5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SDF4Q9BRK5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SDF4Q9BRK5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SDF4Q9BRK5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SDF4Q9BRK5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SDF4Q9BRK5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SDF4Q9BRK5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SDF4Q9BRK5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SDF4Q9BRK5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SDF4Q9BRK5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SDF4Q9BRK5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SDF4Q9BRK5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SDF4Q9BRK5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SDF4Q9BRK5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SDF4Q9BRK5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SDF4Q9BRK5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SDF4Q9BRK5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SDF4Q9BRK5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SDF4Q9BRK5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SDF4Q9BRK5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SDF4Q9BRK5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SDF4Q9BRK5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SDF4Q9BRK5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SDF4Q9BRK5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SDF4Q9BRK5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SDF4Q9BRK5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SDF4Q9BRK5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SDF4Q9BRK5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SDF4Q9BRK5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SDF4Q9BRK5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SDF4Q9BRK5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SDF4Q9BRK5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SDF4Q9BRK5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SDF4Q9BRK5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SDF4Q9BRK5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
SDF4Q9BRK5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SDF4Q9BRK5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SDF4Q9BRK5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SDF4Q9BRK5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SDF4Q9BRK5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SDF4Q9BRK5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SDF4Q9BRK5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SDF4Q9BRK5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SDF4Q9BRK5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
SDF4Q9BRK5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SDF4Q9BRK5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SDF4Q9BRK5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SDF4Q9BRK5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SDF4Q9BRK5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SDF4Q9BRK5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SDF4Q9BRK5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SDF4Q9BRK5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SDF4Q9BRK5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SDF4Q9BRK5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SDF4Q9BRK5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SDF4Q9BRK5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SDF4Q9BRK5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SDF4Q9BRK5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SDF4Q9BRK5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SDF4Q9BRK5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SDF4Q9BRK5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SDF4Q9BRK5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SDF4Q9BRK5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SDF4Q9BRK5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
SDF4Q9BRK5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SDF4Q9BRK5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SDF4Q9BRK5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SDF4Q9BRK5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SDF4Q9BRK5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SDF4Q9BRK5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
SDF4Q9BRK5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SDF4Q9BRK5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SDF4Q9BRK5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SDF4Q9BRK5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SDF4Q9BRK5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SDF4Q9BRK5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SDF4Q9BRK5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SDF4Q9BRK5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SDF4Q9BRK5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SDF4Q9BRK5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SDF4Q9BRK5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SDF4Q9BRK5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SDF4Q9BRK5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SDF4Q9BRK5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SDF4Q9BRK5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SDF4Q9BRK5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SDF4Q9BRK5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SDF4Q9BRK5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SDF4Q9BRK5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SDF4Q9BRK5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SDF4Q9BRK5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SDF4Q9BRK5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SDF4Q9BRK5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SDF4Q9BRK5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SDF4Q9BRK5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SDF4Q9BRK5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms