Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BEST4Q8NFU0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BEST4Q8NFU0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
BEST4Q8NFU0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BEST4Q8NFU0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BEST4Q8NFU0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BEST4Q8NFU0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BEST4Q8NFU0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BEST4Q8NFU0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BEST4Q8NFU0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BEST4Q8NFU0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BEST4Q8NFU0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BEST4Q8NFU0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BEST4Q8NFU0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BEST4Q8NFU0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BEST4Q8NFU0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BEST4Q8NFU0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BEST4Q8NFU0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BEST4Q8NFU0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BEST4Q8NFU0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
BEST4Q8NFU0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
BEST4Q8NFU0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
BEST4Q8NFU0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
BEST4Q8NFU0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BEST4Q8NFU0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BEST4Q8NFU0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BEST4Q8NFU0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BEST4Q8NFU0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BEST4Q8NFU0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
BEST4Q8NFU0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BEST4Q8NFU0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BEST4Q8NFU0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BEST4Q8NFU0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BEST4Q8NFU0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BEST4Q8NFU0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BEST4Q8NFU0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BEST4Q8NFU0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BEST4Q8NFU0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BEST4Q8NFU0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BEST4Q8NFU0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BEST4Q8NFU0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BEST4Q8NFU0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BEST4Q8NFU0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
BEST4Q8NFU0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BEST4Q8NFU0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BEST4Q8NFU0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BEST4Q8NFU0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
BEST4Q8NFU0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BEST4Q8NFU0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BEST4Q8NFU0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BEST4Q8NFU0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BEST4Q8NFU0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BEST4Q8NFU0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BEST4Q8NFU0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BEST4Q8NFU0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BEST4Q8NFU0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BEST4Q8NFU0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BEST4Q8NFU0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BEST4Q8NFU0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BEST4Q8NFU0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
BEST4Q8NFU0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BEST4Q8NFU0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
BEST4Q8NFU0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BEST4Q8NFU0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BEST4Q8NFU0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BEST4Q8NFU0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BEST4Q8NFU0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BEST4Q8NFU0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BEST4Q8NFU0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BEST4Q8NFU0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BEST4Q8NFU0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
BEST4Q8NFU0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BEST4Q8NFU0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
BEST4Q8NFU0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BEST4Q8NFU0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BEST4Q8NFU0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BEST4Q8NFU0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BEST4Q8NFU0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BEST4Q8NFU0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BEST4Q8NFU0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BEST4Q8NFU0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BEST4Q8NFU0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BEST4Q8NFU0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BEST4Q8NFU0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BEST4Q8NFU0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BEST4Q8NFU0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BEST4Q8NFU0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BEST4Q8NFU0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BEST4Q8NFU0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BEST4Q8NFU0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
BEST4Q8NFU0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BEST4Q8NFU0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BEST4Q8NFU0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BEST4Q8NFU0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BEST4Q8NFU0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BEST4Q8NFU0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BEST4Q8NFU0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BEST4Q8NFU0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
BEST4Q8NFU0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
BEST4Q8NFU0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms