Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RIF1Q5UIP0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RIF1Q5UIP0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RIF1Q5UIP0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RIF1Q5UIP0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RIF1Q5UIP0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RIF1Q5UIP0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RIF1Q5UIP0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RIF1Q5UIP0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RIF1Q5UIP0 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RIF1Q5UIP0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RIF1Q5UIP0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RIF1Q5UIP0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RIF1Q5UIP0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RIF1Q5UIP0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RIF1Q5UIP0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RIF1Q5UIP0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RIF1Q5UIP0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RIF1Q5UIP0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RIF1Q5UIP0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RIF1Q5UIP0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RIF1Q5UIP0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RIF1Q5UIP0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RIF1Q5UIP0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RIF1Q5UIP0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RIF1Q5UIP0 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RIF1Q5UIP0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RIF1Q5UIP0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RIF1Q5UIP0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RIF1Q5UIP0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RIF1Q5UIP0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RIF1Q5UIP0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RIF1Q5UIP0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RIF1Q5UIP0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RIF1Q5UIP0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RIF1Q5UIP0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RIF1Q5UIP0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RIF1Q5UIP0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RIF1Q5UIP0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RIF1Q5UIP0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RIF1Q5UIP0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RIF1Q5UIP0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RIF1Q5UIP0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RIF1Q5UIP0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RIF1Q5UIP0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RIF1Q5UIP0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RIF1Q5UIP0 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RIF1Q5UIP0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RIF1Q5UIP0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RIF1Q5UIP0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RIF1Q5UIP0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RIF1Q5UIP0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RIF1Q5UIP0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RIF1Q5UIP0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RIF1Q5UIP0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RIF1Q5UIP0 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RIF1Q5UIP0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RIF1Q5UIP0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RIF1Q5UIP0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RIF1Q5UIP0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RIF1Q5UIP0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RIF1Q5UIP0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RIF1Q5UIP0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RIF1Q5UIP0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RIF1Q5UIP0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
RIF1Q5UIP0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RIF1Q5UIP0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RIF1Q5UIP0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RIF1Q5UIP0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RIF1Q5UIP0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RIF1Q5UIP0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RIF1Q5UIP0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RIF1Q5UIP0 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RIF1Q5UIP0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RIF1Q5UIP0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RIF1Q5UIP0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RIF1Q5UIP0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RIF1Q5UIP0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RIF1Q5UIP0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RIF1Q5UIP0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RIF1Q5UIP0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RIF1Q5UIP0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RIF1Q5UIP0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RIF1Q5UIP0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RIF1Q5UIP0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RIF1Q5UIP0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RIF1Q5UIP0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RIF1Q5UIP0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RIF1Q5UIP0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RIF1Q5UIP0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RIF1Q5UIP0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RIF1Q5UIP0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RIF1Q5UIP0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RIF1Q5UIP0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RIF1Q5UIP0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RIF1Q5UIP0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RIF1Q5UIP0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RIF1Q5UIP0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RIF1Q5UIP0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RIF1Q5UIP0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms