Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GEN1Q17RS7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GEN1Q17RS7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GEN1Q17RS7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GEN1Q17RS7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GEN1Q17RS7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GEN1Q17RS7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GEN1Q17RS7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GEN1Q17RS7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GEN1Q17RS7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GEN1Q17RS7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
GEN1Q17RS7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GEN1Q17RS7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GEN1Q17RS7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
GEN1Q17RS7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GEN1Q17RS7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GEN1Q17RS7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GEN1Q17RS7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GEN1Q17RS7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GEN1Q17RS7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GEN1Q17RS7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GEN1Q17RS7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GEN1Q17RS7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GEN1Q17RS7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GEN1Q17RS7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
GEN1Q17RS7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GEN1Q17RS7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GEN1Q17RS7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
GEN1Q17RS7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
GEN1Q17RS7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GEN1Q17RS7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GEN1Q17RS7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GEN1Q17RS7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GEN1Q17RS7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GEN1Q17RS7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GEN1Q17RS7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GEN1Q17RS7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GEN1Q17RS7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GEN1Q17RS7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GEN1Q17RS7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GEN1Q17RS7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GEN1Q17RS7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GEN1Q17RS7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
GEN1Q17RS7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GEN1Q17RS7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GEN1Q17RS7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GEN1Q17RS7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
GEN1Q17RS7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GEN1Q17RS7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GEN1Q17RS7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GEN1Q17RS7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GEN1Q17RS7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GEN1Q17RS7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GEN1Q17RS7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GEN1Q17RS7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GEN1Q17RS7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GEN1Q17RS7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GEN1Q17RS7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GEN1Q17RS7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GEN1Q17RS7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GEN1Q17RS7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GEN1Q17RS7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GEN1Q17RS7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GEN1Q17RS7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GEN1Q17RS7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
GEN1Q17RS7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GEN1Q17RS7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GEN1Q17RS7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GEN1Q17RS7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GEN1Q17RS7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GEN1Q17RS7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GEN1Q17RS7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GEN1Q17RS7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
GEN1Q17RS7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GEN1Q17RS7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GEN1Q17RS7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GEN1Q17RS7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GEN1Q17RS7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GEN1Q17RS7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GEN1Q17RS7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GEN1Q17RS7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GEN1Q17RS7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GEN1Q17RS7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
GEN1Q17RS7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GEN1Q17RS7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GEN1Q17RS7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GEN1Q17RS7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
GEN1Q17RS7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
GEN1Q17RS7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GEN1Q17RS7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GEN1Q17RS7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GEN1Q17RS7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GEN1Q17RS7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GEN1Q17RS7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GEN1Q17RS7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GEN1Q17RS7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GEN1Q17RS7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GEN1Q17RS7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GEN1Q17RS7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GEN1Q17RS7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
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