Protein–RNA interactions for Protein: Q16385

SSX2, Protein SSX2, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2Q16385 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SSX2Q16385 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SSX2Q16385 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SSX2Q16385 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SSX2Q16385 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SSX2Q16385 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SSX2Q16385 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SSX2Q16385 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SSX2Q16385 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSX2Q16385 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSX2Q16385 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSX2Q16385 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSX2Q16385 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSX2Q16385 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSX2Q16385 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSX2Q16385 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSX2Q16385 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSX2Q16385 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSX2Q16385 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSX2Q16385 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSX2Q16385 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSX2Q16385 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SSX2Q16385 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSX2Q16385 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSX2Q16385 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSX2Q16385 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSX2Q16385 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSX2Q16385 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SSX2Q16385 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSX2Q16385 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSX2Q16385 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSX2Q16385 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSX2Q16385 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSX2Q16385 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSX2Q16385 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSX2Q16385 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSX2Q16385 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSX2Q16385 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSX2Q16385 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSX2Q16385 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSX2Q16385 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSX2Q16385 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSX2Q16385 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSX2Q16385 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSX2Q16385 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSX2Q16385 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSX2Q16385 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSX2Q16385 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SSX2Q16385 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SSX2Q16385 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SSX2Q16385 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSX2Q16385 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSX2Q16385 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSX2Q16385 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSX2Q16385 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSX2Q16385 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SSX2Q16385 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SSX2Q16385 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SSX2Q16385 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSX2Q16385 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSX2Q16385 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSX2Q16385 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSX2Q16385 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSX2Q16385 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSX2Q16385 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSX2Q16385 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSX2Q16385 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSX2Q16385 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSX2Q16385 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSX2Q16385 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSX2Q16385 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSX2Q16385 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSX2Q16385 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSX2Q16385 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSX2Q16385 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSX2Q16385 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSX2Q16385 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSX2Q16385 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSX2Q16385 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSX2Q16385 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SSX2Q16385 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SSX2Q16385 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SSX2Q16385 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SSX2Q16385 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SSX2Q16385 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SSX2Q16385 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SSX2Q16385 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SSX2Q16385 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SSX2Q16385 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SSX2Q16385 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSX2Q16385 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSX2Q16385 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSX2Q16385 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSX2Q16385 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSX2Q16385 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSX2Q16385 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SSX2Q16385 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSX2Q16385 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSX2Q16385 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSX2Q16385 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
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