Protein–RNA interactions for Protein: Q16048

PMCHL1, Putative pro-MCH-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL1Q16048 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PMCHL1Q16048 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PMCHL1Q16048 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PMCHL1Q16048 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PMCHL1Q16048 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PMCHL1Q16048 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PMCHL1Q16048 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PMCHL1Q16048 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PMCHL1Q16048 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PMCHL1Q16048 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PMCHL1Q16048 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PMCHL1Q16048 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PMCHL1Q16048 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PMCHL1Q16048 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PMCHL1Q16048 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PMCHL1Q16048 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PMCHL1Q16048 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PMCHL1Q16048 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PMCHL1Q16048 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PMCHL1Q16048 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PMCHL1Q16048 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PMCHL1Q16048 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PMCHL1Q16048 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PMCHL1Q16048 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PMCHL1Q16048 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PMCHL1Q16048 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PMCHL1Q16048 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PMCHL1Q16048 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PMCHL1Q16048 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PMCHL1Q16048 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PMCHL1Q16048 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PMCHL1Q16048 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PMCHL1Q16048 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PMCHL1Q16048 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PMCHL1Q16048 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PMCHL1Q16048 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PMCHL1Q16048 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PMCHL1Q16048 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PMCHL1Q16048 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PMCHL1Q16048 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PMCHL1Q16048 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PMCHL1Q16048 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PMCHL1Q16048 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PMCHL1Q16048 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PMCHL1Q16048 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PMCHL1Q16048 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PMCHL1Q16048 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PMCHL1Q16048 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PMCHL1Q16048 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PMCHL1Q16048 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PMCHL1Q16048 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PMCHL1Q16048 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PMCHL1Q16048 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PMCHL1Q16048 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PMCHL1Q16048 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PMCHL1Q16048 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PMCHL1Q16048 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PMCHL1Q16048 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PMCHL1Q16048 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PMCHL1Q16048 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PMCHL1Q16048 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PMCHL1Q16048 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PMCHL1Q16048 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PMCHL1Q16048 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PMCHL1Q16048 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PMCHL1Q16048 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PMCHL1Q16048 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PMCHL1Q16048 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PMCHL1Q16048 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PMCHL1Q16048 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PMCHL1Q16048 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PMCHL1Q16048 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PMCHL1Q16048 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PMCHL1Q16048 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PMCHL1Q16048 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PMCHL1Q16048 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PMCHL1Q16048 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PMCHL1Q16048 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PMCHL1Q16048 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PMCHL1Q16048 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PMCHL1Q16048 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PMCHL1Q16048 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PMCHL1Q16048 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PMCHL1Q16048 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PMCHL1Q16048 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PMCHL1Q16048 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PMCHL1Q16048 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PMCHL1Q16048 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PMCHL1Q16048 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PMCHL1Q16048 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PMCHL1Q16048 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PMCHL1Q16048 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PMCHL1Q16048 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PMCHL1Q16048 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PMCHL1Q16048 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PMCHL1Q16048 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PMCHL1Q16048 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PMCHL1Q16048 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PMCHL1Q16048 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PMCHL1Q16048 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms