Protein–RNA interactions for Protein: Q12391

TY1A-NL1, Transposon Ty1-NL1 Gag polyprotein, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-NL1Q12391 STE4YOR212W 1272 nt7.16□□□□□ -1.26
TY1A-NL1Q12391 KTR4YBR199W 1395 nt7.16□□□□□ -1.26
TY1A-NL1Q12391 MDM10YAL010C 1482 nt7.16□□□□□ -1.26
TY1A-NL1Q12391 GET3YDL100C 1065 nt7.15□□□□□ -1.26
TY1A-NL1Q12391 DCD1YHR144C 939 nt7.15□□□□□ -1.26
TY1A-NL1Q12391 YLR366WYLR366W 306 nt7.15□□□□□ -1.26
TY1A-NL1Q12391 RCF1YML030W 480 nt7.15□□□□□ -1.26
TY1A-NL1Q12391 CTL1YMR180C 963 nt7.15□□□□□ -1.26
TY1A-NL1Q12391 YCR025CYCR025C 411 nt7.14□□□□□ -1.27
TY1A-NL1Q12391 PPH22YDL188C 1134 nt7.14□□□□□ -1.27
TY1A-NL1Q12391 HVG1YER039C 750 nt7.14□□□□□ -1.27
TY1A-NL1Q12391 IGD1YFR017C 588 nt7.14□□□□□ -1.27
TY1A-NL1Q12391 YHL045WYHL045W 348 nt7.14□□□□□ -1.27
TY1A-NL1Q12391 YJR096WYJR096W 849 nt7.14□□□□□ -1.27
TY1A-NL1Q12391 YLR349WYLR349W 507 nt7.14□□□□□ -1.27
TY1A-NL1Q12391 RNA170RNA170 169 nt7.14□□□□□ -1.27
TY1A-NL1Q12391 SLZ1YNL196C 897 nt7.14□□□□□ -1.27
TY1A-NL1Q12391 YPL264CYPL264C 1062 nt7.14□□□□□ -1.27
TY1A-NL1Q12391 TIF5YPR041W 1218 nt7.14□□□□□ -1.27
TY1A-NL1Q12391 ITR1YDR497C 1755 nt7.13□□□□□ -1.27
TY1A-NL1Q12391 PRC1YMR297W 1599 nt7.13□□□□□ -1.27
TY1A-NL1Q12391 YPL245WYPL245W 1365 nt7.13□□□□□ -1.27
TY1A-NL1Q12391 YGL235WYGL235W 537 nt7.13□□□□□ -1.27
TY1A-NL1Q12391 YGR291CYGR291C 222 nt7.13□□□□□ -1.27
TY1A-NL1Q12391 MOB1YIL106W 945 nt7.13□□□□□ -1.27
TY1A-NL1Q12391 YOR020W-AYOR020W-A 273 nt7.13□□□□□ -1.27
TY1A-NL1Q12391 YBR298C-AYBR298C-A 222 nt7.13□□□□□ -1.27
TY1A-NL1Q12391 ARO10YDR380W 1908 nt7.13□□□□□ -1.27
TY1A-NL1Q12391 WSC3YOL105C 1671 nt7.12□□□□□ -1.27
TY1A-NL1Q12391 SGF73YGL066W 1974 nt7.12□□□□□ -1.27
TY1A-NL1Q12391 ARO3YDR035W 1113 nt7.12□□□□□ -1.27
TY1A-NL1Q12391 RRT6YGL146C 936 nt7.12□□□□□ -1.27
TY1A-NL1Q12391 CHS7YHR142W 951 nt7.12□□□□□ -1.27
TY1A-NL1Q12391 HCR1YLR192C 798 nt7.12□□□□□ -1.27
TY1A-NL1Q12391 SNU71YGR013W 1863 nt7.11□□□□□ -1.27
TY1A-NL1Q12391 CBS1YDL069C 690 nt7.11□□□□□ -1.27
TY1A-NL1Q12391 LSM6YDR378C 261 nt7.11□□□□□ -1.27
TY1A-NL1Q12391 CSG2YBR036C 1233 nt7.11□□□□□ -1.27
TY1A-NL1Q12391 PMT1YDL095W 2454 nt7.11□□□□□ -1.27
TY1A-NL1Q12391 HXT9YJL219W 1704 nt7.1□□□□□ -1.27
TY1A-NL1Q12391 CIT2YCR005C 1383 nt7.1□□□□□ -1.27
TY1A-NL1Q12391 CLD1YGR110W 1338 nt7.1□□□□□ -1.27
TY1A-NL1Q12391 LAS17YOR181W 1902 nt7.1□□□□□ -1.27
TY1A-NL1Q12391 EAF5YEL018W 840 nt7.1□□□□□ -1.27
TY1A-NL1Q12391 ARI1YGL157W 1044 nt7.1□□□□□ -1.27
TY1A-NL1Q12391 YGR137WYGR137W 375 nt7.1□□□□□ -1.27
TY1A-NL1Q12391 AIM23YJL131C 1071 nt7.1□□□□□ -1.27
TY1A-NL1Q12391 YLR202CYLR202C 327 nt7.1□□□□□ -1.27
TY1A-NL1Q12391 NDL1YLR254C 570 nt7.1□□□□□ -1.27
TY1A-NL1Q12391 MET22YOL064C 1074 nt7.1□□□□□ -1.27
TY1A-NL1Q12391 INP54YOL065C 1155 nt7.1□□□□□ -1.27
TY1A-NL1Q12391 OLA1YBR025C 1185 nt7.1□□□□□ -1.27
TY1A-NL1Q12391 TGS1YPL157W 948 nt7.1□□□□□ -1.27
TY1A-NL1Q12391 ESC2YDR363W 1371 nt7.09□□□□□ -1.27
TY1A-NL1Q12391 CLB4YLR210W 1383 nt7.09□□□□□ -1.27
TY1A-NL1Q12391 DPB2YPR175W 2070 nt7.09□□□□□ -1.27
TY1A-NL1Q12391 YCR016WYCR016W 873 nt7.09□□□□□ -1.27
TY1A-NL1Q12391 PET18YCR020C 648 nt7.09□□□□□ -1.27
TY1A-NL1Q12391 SHR3YDL212W 633 nt7.09□□□□□ -1.27
TY1A-NL1Q12391 BTT1YDR252W 450 nt7.09□□□□□ -1.27
TY1A-NL1Q12391 MTR2YKL186C 555 nt7.09□□□□□ -1.27
TY1A-NL1Q12391 TAP42YMR028W 1101 nt7.09□□□□□ -1.27
TY1A-NL1Q12391 THI80YOR143C 960 nt7.09□□□□□ -1.27
TY1A-NL1Q12391 BEM1YBR200W 1656 nt7.09□□□□□ -1.27
TY1A-NL1Q12391 YKR023WYKR023W 1593 nt7.08□□□□□ -1.28
TY1A-NL1Q12391 YER152CYER152C 1332 nt7.08□□□□□ -1.28
TY1A-NL1Q12391 GEP7YGL057C 864 nt7.08□□□□□ -1.28
TY1A-NL1Q12391 WSS1YHR134W 810 nt7.08□□□□□ -1.28
TY1A-NL1Q12391 FLX1YIL134W 936 nt7.08□□□□□ -1.28
TY1A-NL1Q12391 SPE4YLR146C 903 nt7.08□□□□□ -1.28
TY1A-NL1Q12391 YMR181CYMR181C 465 nt7.08□□□□□ -1.28
TY1A-NL1Q12391 MSO1YNR049C 633 nt7.08□□□□□ -1.28
TY1A-NL1Q12391 SPO77YLR341W 1434 nt7.08□□□□□ -1.28
TY1A-NL1Q12391 PRP40YKL012W 1752 nt7.08□□□□□ -1.28
TY1A-NL1Q12391 RSC9YML127W 1746 nt7.07□□□□□ -1.28
TY1A-NL1Q12391 PDC6YGR087C 1692 nt7.07□□□□□ -1.28
TY1A-NL1Q12391 YDR222WYDR222W 1248 nt7.07□□□□□ -1.28
TY1A-NL1Q12391 PIB1YDR313C 861 nt7.07□□□□□ -1.28
TY1A-NL1Q12391 PAU5YFL020C 369 nt7.07□□□□□ -1.28
TY1A-NL1Q12391 SCEIQ0160 708 nt7.07□□□□□ -1.28
TY1A-NL1Q12391 DCG1YIR030C 735 nt7.07□□□□□ -1.28
TY1A-NL1Q12391 END3YNL084C 1050 nt7.07□□□□□ -1.28
TY1A-NL1Q12391 OMS1YDR316W 1416 nt7.07□□□□□ -1.28
TY1A-NL1Q12391 CLP1YOR250C 1338 nt7.06□□□□□ -1.28
TY1A-NL1Q12391 SRP102YKL154W 735 nt7.06□□□□□ -1.28
TY1A-NL1Q12391 ERV25YML012W 636 nt7.06□□□□□ -1.28
TY1A-NL1Q12391 CSM3YMR048W 954 nt7.06□□□□□ -1.28
TY1A-NL1Q12391 ELP6YMR312W 822 nt7.06□□□□□ -1.28
TY1A-NL1Q12391 NSG2YNL156C 900 nt7.06□□□□□ -1.28
TY1A-NL1Q12391 YLR173WYLR173W 1827 nt7.06□□□□□ -1.28
TY1A-NL1Q12391 TPO1YLL028W 1761 nt7.05□□□□□ -1.28
TY1A-NL1Q12391 YDR008CYDR008C 351 nt7.05□□□□□ -1.28
TY1A-NL1Q12391 YDR220CYDR220C 294 nt7.05□□□□□ -1.28
TY1A-NL1Q12391 CKB1YGL019W 837 nt7.05□□□□□ -1.28
TY1A-NL1Q12391 HYM1YKL189W 1200 nt7.05□□□□□ -1.28
TY1A-NL1Q12391 YLR280CYLR280C 351 nt7.05□□□□□ -1.28
TY1A-NL1Q12391 YGP1YNL160W 1065 nt7.05□□□□□ -1.28
TY1A-NL1Q12391 YNL194CYNL194C 906 nt7.05□□□□□ -1.28
TY1A-NL1Q12391 YOL050CYOL050C 321 nt7.05□□□□□ -1.28
TY1A-NL1Q12391 YDC1YPL087W 954 nt7.05□□□□□ -1.28
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