Protein–RNA interactions for Protein: Q08923

CTI6, Histone deacetylase complex subunit CTI6, yeastyeast

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CTI6Q08923 YDL144CYDL144C 1071 nt8.28□□□□□ -1.08
CTI6Q08923 YGL102CYGL102C 429 nt8.28□□□□□ -1.08
CTI6Q08923 CUP2YGL166W 678 nt8.28□□□□□ -1.08
CTI6Q08923 PRE3YJL001W 648 nt8.28□□□□□ -1.08
CTI6Q08923 YMR253CYMR253C 1245 nt8.28□□□□□ -1.08
CTI6Q08923 YBR027CYBR027C 333 nt8.28□□□□□ -1.08
CTI6Q08923 MAL31YBR298C 1845 nt8.28□□□□□ -1.08
CTI6Q08923 FLC2YAL053W 2352 nt8.27□□□□□ -1.09
CTI6Q08923 YCR049CYCR049C 447 nt8.27□□□□□ -1.09
CTI6Q08923 GNA1YFL017C 480 nt8.27□□□□□ -1.09
CTI6Q08923 PRI1YIR008C 1230 nt8.27□□□□□ -1.09
CTI6Q08923 YAL045CYAL045C 309 nt8.27□□□□□ -1.09
CTI6Q08923 YGL260WYGL260W 231 nt8.26□□□□□ -1.09
CTI6Q08923 NUP84YDL116W 2181 nt8.26□□□□□ -1.09
CTI6Q08923 PRB1YEL060C 1908 nt8.25□□□□□ -1.09
CTI6Q08923 YKL077WYKL077W 1179 nt8.25□□□□□ -1.09
CTI6Q08923 YKR045CYKR045C 552 nt8.25□□□□□ -1.09
CTI6Q08923 MHT1YLL062C 975 nt8.25□□□□□ -1.09
CTI6Q08923 YNL097W-AYNL097W-A 156 nt8.25□□□□□ -1.09
CTI6Q08923 ILV2YMR108W 2064 nt8.25□□□□□ -1.09
CTI6Q08923 CDC7YDL017W 1524 nt8.24□□□□□ -1.09
CTI6Q08923 YKL102CYKL102C 306 nt8.24□□□□□ -1.09
CTI6Q08923 YMR295CYMR295C 594 nt8.24□□□□□ -1.09
CTI6Q08923 RPL43AYPR043W 279 nt8.24□□□□□ -1.09
CTI6Q08923 FRT1YOR324C 1809 nt8.24□□□□□ -1.09
CTI6Q08923 VMA3YEL027W 483 nt8.23□□□□□ -1.09
CTI6Q08923 ZRT2YLR130C 1269 nt8.23□□□□□ -1.09
CTI6Q08923 CUE4YML101C 354 nt8.23□□□□□ -1.09
CTI6Q08923 RTC2YBR147W 891 nt8.23□□□□□ -1.09
CTI6Q08923 ZWF1YNL241C 1518 nt8.23□□□□□ -1.09
CTI6Q08923 CDC23YHR166C 1881 nt8.22□□□□□ -1.09
CTI6Q08923 YLR157W-EYLR157W-E 165 nt8.22□□□□□ -1.09
CTI6Q08923 FPR3YML074C 1236 nt8.22□□□□□ -1.09
CTI6Q08923 ADH5YBR145W 1056 nt8.22□□□□□ -1.09
CTI6Q08923 GAL2YLR081W 1725 nt8.21□□□□□ -1.09
CTI6Q08923 TPI1YDR050C 747 nt8.21□□□□□ -1.1
CTI6Q08923 ATP10YLR393W 840 nt8.21□□□□□ -1.1
CTI6Q08923 MRPL10YNL284C 969 nt8.21□□□□□ -1.1
CTI6Q08923 ENB1YOL158C 1821 nt8.21□□□□□ -1.1
CTI6Q08923 LYS21YDL131W 1323 nt8.21□□□□□ -1.1
CTI6Q08923 MRPS28YDR337W 861 nt8.2□□□□□ -1.1
CTI6Q08923 UIP4YPL186C 915 nt8.2□□□□□ -1.1
CTI6Q08923 YDR327WYDR327W 327 nt8.19□□□□□ -1.1
CTI6Q08923 RPS28AYOR167C 204 nt8.19□□□□□ -1.1
CTI6Q08923 DLD1YDL174C 1764 nt8.19□□□□□ -1.1
CTI6Q08923 TOD6YBL054W 1578 nt8.18□□□□□ -1.1
CTI6Q08923 AQR1YNL065W 1761 nt8.18□□□□□ -1.1
CTI6Q08923 YER137CYER137C 447 nt8.18□□□□□ -1.1
CTI6Q08923 SMX3YPR182W 261 nt8.18□□□□□ -1.1
CTI6Q08923 GNP1YDR508C 1992 nt8.18□□□□□ -1.1
CTI6Q08923 PEX3YDR329C 1326 nt8.18□□□□□ -1.1
CTI6Q08923 REC107YJR021C 945 nt8.17□□□□□ -1.1
CTI6Q08923 RNH1YMR234W 1047 nt8.17□□□□□ -1.1
CTI6Q08923 ATO2YNR002C 849 nt8.17□□□□□ -1.1
CTI6Q08923 POB3YML069W 1659 nt8.16□□□□□ -1.1
CTI6Q08923 VBA5YKR105C 1749 nt8.15□□□□□ -1.11
CTI6Q08923 BNA3YJL060W 1335 nt8.14□□□□□ -1.11
CTI6Q08923 UIP5YKR044W 1332 nt8.14□□□□□ -1.11
CTI6Q08923 SEC62YPL094C 825 nt8.14□□□□□ -1.11
CTI6Q08923 EXG2YDR261C 1689 nt8.14□□□□□ -1.11
CTI6Q08923 SPG5YMR191W 1122 nt8.12□□□□□ -1.11
CTI6Q08923 MSS51YLR203C 1311 nt8.11□□□□□ -1.11
CTI6Q08923 YHL018WYHL018W 363 nt8.11□□□□□ -1.11
CTI6Q08923 MPC2YHR162W 390 nt8.11□□□□□ -1.11
CTI6Q08923 MRPL23YOR150W 492 nt8.11□□□□□ -1.11
CTI6Q08923 CTA1YDR256C 1548 nt8.11□□□□□ -1.11
CTI6Q08923 DSF1YEL070W 1509 nt8.11□□□□□ -1.11
CTI6Q08923 YNR073CYNR073C 1509 nt8.11□□□□□ -1.11
CTI6Q08923 GGC1YDL198C 903 nt8.1□□□□□ -1.11
CTI6Q08923 HPT1YDR399W 666 nt8.1□□□□□ -1.11
CTI6Q08923 SWD1YAR003W 1281 nt8.1□□□□□ -1.11
CTI6Q08923 SEN34YAR008W 828 nt8.1□□□□□ -1.11
CTI6Q08923 FCY2YER056C 1602 nt8.1□□□□□ -1.11
CTI6Q08923 GTS1YGL181W 1191 nt8.09□□□□□ -1.11
CTI6Q08923 PTC7YHR076W 1032 nt8.09□□□□□ -1.11
CTI6Q08923 MOG1YJR074W 657 nt8.09□□□□□ -1.11
CTI6Q08923 SGF29YCL010C 780 nt8.09□□□□□ -1.11
CTI6Q08923 DOT1YDR440W 1749 nt8.09□□□□□ -1.11
CTI6Q08923 YKL018C-AYKL018C-A 300 nt8.08□□□□□ -1.12
CTI6Q08923 SNN1YNL086W 309 nt8.08□□□□□ -1.12
CTI6Q08923 SCS7YMR272C 1155 nt8.07□□□□□ -1.12
CTI6Q08923 LIP5YOR196C 1245 nt8.07□□□□□ -1.12
CTI6Q08923 PHO85YPL031C 918 nt8.07□□□□□ -1.12
CTI6Q08923 PPH22YDL188C 1134 nt8.06□□□□□ -1.12
CTI6Q08923 THR1YHR025W 1074 nt8.06□□□□□ -1.12
CTI6Q08923 LOT6YLR011W 576 nt8.06□□□□□ -1.12
CTI6Q08923 FCP1YMR277W 2199 nt8.05□□□□□ -1.12
CTI6Q08923 EMP65YER140W 1671 nt8.05□□□□□ -1.12
CTI6Q08923 MHP1YJL042W 4197 nt8.05□□□□□ -1.12
CTI6Q08923 GPA2YER020W 1350 nt8.05□□□□□ -1.12
CTI6Q08923 YPR196WYPR196W 1413 nt8.04□□□□□ -1.12
CTI6Q08923 CTF3YLR381W 2202 nt8.04□□□□□ -1.12
CTI6Q08923 IVY1YDR229W 1362 nt8.04□□□□□ -1.12
CTI6Q08923 CAN1YEL063C 1773 nt8.04□□□□□ -1.12
CTI6Q08923 NUP57YGR119C 1626 nt8.03□□□□□ -1.12
CTI6Q08923 NAS6YGR232W 687 nt8.03□□□□□ -1.12
CTI6Q08923 RPL31BYLR406C 342 nt8.03□□□□□ -1.12
CTI6Q08923 RAD59YDL059C 717 nt8.02□□□□□ -1.13
CTI6Q08923 HVG1YER039C 750 nt8.02□□□□□ -1.13
CTI6Q08923 CCT8YJL008C 1707 nt8.02□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 22 ms