Protein–RNA interactions for Protein: Q07807

PUF3, mRNA-binding protein PUF3, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUF3Q07807 YHR131CYHR131C 2553 nt7.63□□□□□ -1.19
PUF3Q07807 KAE1YKR038C 1161 nt7.62□□□□□ -1.19
PUF3Q07807 MSA2YKR077W 1092 nt7.62□□□□□ -1.19
PUF3Q07807 YLR358CYLR358C 564 nt7.62□□□□□ -1.19
PUF3Q07807 OSW1YOR255W 837 nt7.62□□□□□ -1.19
PUF3Q07807 MAS2YHR024C 1449 nt7.61□□□□□ -1.19 RIP-Chip
PUF3Q07807 YGL260WYGL260W 231 nt7.61□□□□□ -1.19
PUF3Q07807 PIL1YGR086C 1020 nt7.61□□□□□ -1.19
PUF3Q07807 YKL147CYKL147C 618 nt7.61□□□□□ -1.19
PUF3Q07807 IDP3YNL009W 1263 nt7.61□□□□□ -1.19
PUF3Q07807 YIL092WYIL092W 1902 nt7.6□□□□□ -1.19 RIP-Chip
PUF3Q07807 NUP57YGR119C 1626 nt7.6□□□□□ -1.19
PUF3Q07807 ERR3YMR323W 1314 nt7.6□□□□□ -1.19
PUF3Q07807 ERR1YOR393W 1314 nt7.6□□□□□ -1.19
PUF3Q07807 ERR2YPL281C 1314 nt7.6□□□□□ -1.19
PUF3Q07807 CDC3YLR314C 1563 nt7.6□□□□□ -1.19
PUF3Q07807 PEX22YAL055W 543 nt7.6□□□□□ -1.19
PUF3Q07807 ECM9YKR004C 1134 nt7.6□□□□□ -1.19
PUF3Q07807 CCW12YLR110C 402 nt7.6□□□□□ -1.19
PUF3Q07807 CSI1YMR025W 888 nt7.6□□□□□ -1.19
PUF3Q07807 CAN1YEL063C 1773 nt7.6□□□□□ -1.19
PUF3Q07807 ATG22YCL038C 1587 nt7.59□□□□□ -1.19
PUF3Q07807 TOP3YLR234W 1971 nt7.59□□□□□ -1.19
PUF3Q07807 RPL12BYDR418W 498 nt7.59□□□□□ -1.19
PUF3Q07807 PTC7YHR076W 1032 nt7.59□□□□□ -1.19
PUF3Q07807 LIP5YOR196C 1245 nt7.59□□□□□ -1.19
PUF3Q07807 DOC1YGL240W 753 nt7.58□□□□□ -1.2
PUF3Q07807 YJL213WYJL213W 996 nt7.58□□□□□ -1.2
PUF3Q07807 SUT2YPR009W 807 nt7.58□□□□□ -1.2
PUF3Q07807 CCR4YAL021C 2514 nt7.58□□□□□ -1.2
PUF3Q07807 YGR283CYGR283C 1026 nt7.57□□□□□ -1.2
PUF3Q07807 YLR169WYLR169W 354 nt7.57□□□□□ -1.2
PUF3Q07807 YMR253CYMR253C 1245 nt7.57□□□□□ -1.2
PUF3Q07807 snR189snR189 189 nt7.57□□□□□ -1.2
PUF3Q07807 RMD8YFR048W 1989 nt7.57□□□□□ -1.2
PUF3Q07807 NPL6YMR091C 1308 nt7.56□□□□□ -1.2
PUF3Q07807 RER1YCL001W 567 nt7.56□□□□□ -1.2
PUF3Q07807 FLC2YAL053W 2352 nt7.56□□□□□ -1.2
PUF3Q07807 YKR018CYKR018C 2178 nt7.56□□□□□ -1.2
PUF3Q07807 PRB1YEL060C 1908 nt7.55□□□□□ -1.2
PUF3Q07807 DBR1YKL149C 1218 nt7.55□□□□□ -1.2
PUF3Q07807 SPC24YMR117C 642 nt7.55□□□□□ -1.2
PUF3Q07807 VAM3YOR106W 852 nt7.55□□□□□ -1.2
PUF3Q07807 PET117YER058W 324 nt7.54□□□□□ -1.2
PUF3Q07807 YER137CYER137C 447 nt7.54□□□□□ -1.2
PUF3Q07807 REX3YLR107W 1215 nt7.54□□□□□ -1.2
PUF3Q07807 RDR1YOR380W 1641 nt7.53□□□□□ -1.2
PUF3Q07807 SUF3tG(CCC)D 72 nt7.53□□□□□ -1.2
PUF3Q07807 COS6YGR295C 1146 nt7.53□□□□□ -1.2
PUF3Q07807 YHR022CYHR022C 771 nt7.53□□□□□ -1.2
PUF3Q07807 YML122CYML122C 381 nt7.53□□□□□ -1.2
PUF3Q07807 FES1YBR101C 873 nt7.53□□□□□ -1.2
PUF3Q07807 CDC7YDL017W 1524 nt7.52□□□□□ -1.2
PUF3Q07807 POB3YML069W 1659 nt7.52□□□□□ -1.21
PUF3Q07807 ISR1YPR106W 1332 nt7.52□□□□□ -1.21
PUF3Q07807 CIT2YCR005C 1383 nt7.51□□□□□ -1.21
PUF3Q07807 MHO1YJR008W 1017 nt7.51□□□□□ -1.21
PUF3Q07807 YLR412C-AYLR412C-A 207 nt7.51□□□□□ -1.21
PUF3Q07807 DSC2YOL073C 969 nt7.51□□□□□ -1.21
PUF3Q07807 ISA2YPR067W 558 nt7.51□□□□□ -1.21 RIP-Chip
PUF3Q07807 SDH8YBR269C 417 nt7.51□□□□□ -1.21
PUF3Q07807 BUD16YEL029C 939 nt7.5□□□□□ -1.21
PUF3Q07807 HAT2YEL056W 1206 nt7.5□□□□□ -1.21
PUF3Q07807 EDC2YER035W 438 nt7.5□□□□□ -1.21
PUF3Q07807 YKR104WYKR104W 921 nt7.5□□□□□ -1.21
PUF3Q07807 SEC24YIL109C 2781 nt7.5□□□□□ -1.21
PUF3Q07807 FCY2YER056C 1602 nt7.49□□□□□ -1.21
PUF3Q07807 GGC1YDL198C 903 nt7.49□□□□□ -1.21
PUF3Q07807 YMR119W-AYMR119W-A 375 nt7.49□□□□□ -1.21
PUF3Q07807 MRPL24YMR193W 777 nt7.49□□□□□ -1.21 RIP-Chip
PUF3Q07807 ADH6YMR318C 1083 nt7.49□□□□□ -1.21
PUF3Q07807 ATP23YNR020C 813 nt7.49□□□□□ -1.21 RIP-Chip
PUF3Q07807 ARC35YNR035C 1029 nt7.49□□□□□ -1.21
PUF3Q07807 FRT1YOR324C 1809 nt7.49□□□□□ -1.21
PUF3Q07807 TOD6YBL054W 1578 nt7.49□□□□□ -1.21
PUF3Q07807 NUF2YOL069W 1356 nt7.48□□□□□ -1.21
PUF3Q07807 MAD2YJL030W 591 nt7.48□□□□□ -1.21
PUF3Q07807 YLR198CYLR198C 360 nt7.48□□□□□ -1.21
PUF3Q07807 POS5YPL188W 1245 nt7.48□□□□□ -1.21
PUF3Q07807 RPL43AYPR043W 279 nt7.48□□□□□ -1.21
PUF3Q07807 ARR1YPR199C 885 nt7.48□□□□□ -1.21
PUF3Q07807 NUR1YDL089W 1455 nt7.48□□□□□ -1.21
PUF3Q07807 RTG3YBL103C 1461 nt7.48□□□□□ -1.21
PUF3Q07807 CMK2YOL016C 1344 nt7.48□□□□□ -1.21
PUF3Q07807 RSF1YMR030W 1131 nt7.47□□□□□ -1.21
PUF3Q07807 ERG29YMR134W 714 nt7.47□□□□□ -1.21
PUF3Q07807 DPM1YPR183W 804 nt7.47□□□□□ -1.21
PUF3Q07807 PMA2YPL036W 2844 nt7.47□□□□□ -1.21
PUF3Q07807 ECM27YJR106W 2178 nt7.47□□□□□ -1.21
PUF3Q07807 EXG2YDR261C 1689 nt7.47□□□□□ -1.21
PUF3Q07807 ERG12YMR208W 1332 nt7.47□□□□□ -1.21
PUF3Q07807 ENB1YOL158C 1821 nt7.46□□□□□ -1.21
PUF3Q07807 LOT6YLR011W 576 nt7.46□□□□□ -1.22
PUF3Q07807 RRP40YOL142W 723 nt7.46□□□□□ -1.22
PUF3Q07807 TSR3YOR006C 942 nt7.46□□□□□ -1.22
PUF3Q07807 PGI1YBR196C 1665 nt7.46□□□□□ -1.22
PUF3Q07807 AQR1YNL065W 1761 nt7.46□□□□□ -1.22
PUF3Q07807 YPQ2YDR352W 954 nt7.45□□□□□ -1.22
PUF3Q07807 PIH1YHR034C 1035 nt7.45□□□□□ -1.22
PUF3Q07807 FSH1YHR049W 732 nt7.45□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 34.4 ms