Protein–RNA interactions for Protein: P62955

CACNG7, Voltage-dependent calcium channel gamma-7 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG7P62955 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNG7P62955 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNG7P62955 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNG7P62955 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNG7P62955 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNG7P62955 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNG7P62955 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNG7P62955 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNG7P62955 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNG7P62955 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNG7P62955 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNG7P62955 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNG7P62955 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNG7P62955 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNG7P62955 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNG7P62955 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNG7P62955 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNG7P62955 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNG7P62955 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNG7P62955 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CACNG7P62955 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CACNG7P62955 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNG7P62955 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNG7P62955 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNG7P62955 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNG7P62955 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNG7P62955 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNG7P62955 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNG7P62955 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNG7P62955 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNG7P62955 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNG7P62955 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNG7P62955 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNG7P62955 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNG7P62955 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNG7P62955 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNG7P62955 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNG7P62955 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNG7P62955 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNG7P62955 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNG7P62955 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNG7P62955 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNG7P62955 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNG7P62955 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNG7P62955 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNG7P62955 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNG7P62955 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNG7P62955 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNG7P62955 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNG7P62955 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNG7P62955 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNG7P62955 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNG7P62955 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNG7P62955 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNG7P62955 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNG7P62955 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNG7P62955 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNG7P62955 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNG7P62955 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNG7P62955 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNG7P62955 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNG7P62955 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNG7P62955 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNG7P62955 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNG7P62955 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNG7P62955 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNG7P62955 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNG7P62955 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNG7P62955 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNG7P62955 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNG7P62955 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNG7P62955 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNG7P62955 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNG7P62955 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNG7P62955 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNG7P62955 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNG7P62955 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNG7P62955 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNG7P62955 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNG7P62955 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNG7P62955 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNG7P62955 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNG7P62955 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNG7P62955 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNG7P62955 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNG7P62955 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNG7P62955 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNG7P62955 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNG7P62955 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNG7P62955 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNG7P62955 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNG7P62955 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNG7P62955 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNG7P62955 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNG7P62955 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNG7P62955 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNG7P62955 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNG7P62955 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNG7P62955 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNG7P62955 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms