Protein–RNA interactions for Protein: P52954

LBX1, Transcription factor LBX1, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBX1P52954 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LBX1P52954 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LBX1P52954 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LBX1P52954 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LBX1P52954 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
LBX1P52954 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
LBX1P52954 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LBX1P52954 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LBX1P52954 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC29■■■□□ 2.23
LBX1P52954 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LBX1P52954 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LBX1P52954 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LBX1P52954 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LBX1P52954 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LBX1P52954 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LBX1P52954 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LBX1P52954 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
LBX1P52954 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LBX1P52954 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LBX1P52954 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
LBX1P52954 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LBX1P52954 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LBX1P52954 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LBX1P52954 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LBX1P52954 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LBX1P52954 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LBX1P52954 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LBX1P52954 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LBX1P52954 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
LBX1P52954 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
LBX1P52954 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
LBX1P52954 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LBX1P52954 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LBX1P52954 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LBX1P52954 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
LBX1P52954 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LBX1P52954 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
LBX1P52954 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
LBX1P52954 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
LBX1P52954 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LBX1P52954 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LBX1P52954 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
LBX1P52954 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LBX1P52954 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LBX1P52954 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LBX1P52954 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LBX1P52954 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
LBX1P52954 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
LBX1P52954 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LBX1P52954 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
LBX1P52954 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LBX1P52954 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LBX1P52954 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LBX1P52954 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
LBX1P52954 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
LBX1P52954 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
LBX1P52954 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
LBX1P52954 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
LBX1P52954 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
LBX1P52954 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
LBX1P52954 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
LBX1P52954 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.21
LBX1P52954 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LBX1P52954 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LBX1P52954 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LBX1P52954 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LBX1P52954 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LBX1P52954 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LBX1P52954 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
LBX1P52954 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LBX1P52954 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
LBX1P52954 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LBX1P52954 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LBX1P52954 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LBX1P52954 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LBX1P52954 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LBX1P52954 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LBX1P52954 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
LBX1P52954 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LBX1P52954 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LBX1P52954 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LBX1P52954 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LBX1P52954 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LBX1P52954 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LBX1P52954 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LBX1P52954 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LBX1P52954 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LBX1P52954 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
LBX1P52954 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LBX1P52954 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LBX1P52954 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LBX1P52954 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LBX1P52954 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LBX1P52954 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LBX1P52954 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LBX1P52954 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LBX1P52954 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
LBX1P52954 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LBX1P52954 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LBX1P52954 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms