Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
MRE11P49959 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MRE11P49959 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MRE11P49959 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
MRE11P49959 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MRE11P49959 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MRE11P49959 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MRE11P49959 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MRE11P49959 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MRE11P49959 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
MRE11P49959 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MRE11P49959 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MRE11P49959 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
MRE11P49959 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
MRE11P49959 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MRE11P49959 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
MRE11P49959 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MRE11P49959 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MRE11P49959 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MRE11P49959 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MRE11P49959 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MRE11P49959 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
MRE11P49959 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MRE11P49959 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MRE11P49959 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MRE11P49959 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MRE11P49959 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
MRE11P49959 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MRE11P49959 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MRE11P49959 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MRE11P49959 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MRE11P49959 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MRE11P49959 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MRE11P49959 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MRE11P49959 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
MRE11P49959 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
MRE11P49959 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
MRE11P49959 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MRE11P49959 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
MRE11P49959 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MRE11P49959 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MRE11P49959 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MRE11P49959 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MRE11P49959 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MRE11P49959 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MRE11P49959 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MRE11P49959 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MRE11P49959 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MRE11P49959 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MRE11P49959 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MRE11P49959 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MRE11P49959 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MRE11P49959 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MRE11P49959 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MRE11P49959 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MRE11P49959 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MRE11P49959 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MRE11P49959 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MRE11P49959 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MRE11P49959 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MRE11P49959 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MRE11P49959 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MRE11P49959 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MRE11P49959 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MRE11P49959 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MRE11P49959 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MRE11P49959 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MRE11P49959 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MRE11P49959 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
MRE11P49959 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MRE11P49959 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MRE11P49959 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MRE11P49959 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MRE11P49959 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MRE11P49959 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MRE11P49959 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MRE11P49959 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MRE11P49959 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MRE11P49959 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MRE11P49959 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MRE11P49959 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MRE11P49959 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MRE11P49959 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
MRE11P49959 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MRE11P49959 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MRE11P49959 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MRE11P49959 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MRE11P49959 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MRE11P49959 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MRE11P49959 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MRE11P49959 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MRE11P49959 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MRE11P49959 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MRE11P49959 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
MRE11P49959 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MRE11P49959 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MRE11P49959 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MRE11P49959 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MRE11P49959 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MRE11P49959 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms