Protein–RNA interactions for Protein: P48643

CCT5, T-complex protein 1 subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT5P48643 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCT5P48643 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCT5P48643 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCT5P48643 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCT5P48643 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCT5P48643 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCT5P48643 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCT5P48643 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCT5P48643 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCT5P48643 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCT5P48643 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCT5P48643 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCT5P48643 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCT5P48643 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCT5P48643 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCT5P48643 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCT5P48643 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCT5P48643 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCT5P48643 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCT5P48643 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CCT5P48643 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCT5P48643 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCT5P48643 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCT5P48643 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCT5P48643 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCT5P48643 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CCT5P48643 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCT5P48643 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCT5P48643 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCT5P48643 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCT5P48643 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCT5P48643 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCT5P48643 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCT5P48643 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCT5P48643 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCT5P48643 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCT5P48643 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCT5P48643 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCT5P48643 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCT5P48643 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCT5P48643 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCT5P48643 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCT5P48643 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCT5P48643 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCT5P48643 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCT5P48643 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCT5P48643 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCT5P48643 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CCT5P48643 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCT5P48643 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCT5P48643 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CCT5P48643 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CCT5P48643 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCT5P48643 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CCT5P48643 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCT5P48643 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCT5P48643 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCT5P48643 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCT5P48643 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCT5P48643 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCT5P48643 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCT5P48643 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCT5P48643 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCT5P48643 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCT5P48643 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCT5P48643 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCT5P48643 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCT5P48643 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CCT5P48643 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCT5P48643 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCT5P48643 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCT5P48643 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCT5P48643 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCT5P48643 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCT5P48643 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCT5P48643 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCT5P48643 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCT5P48643 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCT5P48643 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCT5P48643 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCT5P48643 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCT5P48643 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCT5P48643 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCT5P48643 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCT5P48643 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCT5P48643 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCT5P48643 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCT5P48643 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCT5P48643 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCT5P48643 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CCT5P48643 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCT5P48643 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCT5P48643 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCT5P48643 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCT5P48643 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCT5P48643 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCT5P48643 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCT5P48643 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCT5P48643 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCT5P48643 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.4 ms