Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMB9P28065 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMB9P28065 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMB9P28065 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMB9P28065 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMB9P28065 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMB9P28065 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMB9P28065 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMB9P28065 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMB9P28065 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMB9P28065 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMB9P28065 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMB9P28065 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMB9P28065 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMB9P28065 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMB9P28065 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMB9P28065 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMB9P28065 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMB9P28065 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMB9P28065 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMB9P28065 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMB9P28065 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMB9P28065 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMB9P28065 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMB9P28065 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMB9P28065 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMB9P28065 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMB9P28065 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMB9P28065 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMB9P28065 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMB9P28065 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMB9P28065 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMB9P28065 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMB9P28065 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMB9P28065 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMB9P28065 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMB9P28065 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMB9P28065 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMB9P28065 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMB9P28065 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMB9P28065 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMB9P28065 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMB9P28065 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMB9P28065 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMB9P28065 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMB9P28065 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMB9P28065 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMB9P28065 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMB9P28065 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMB9P28065 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMB9P28065 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMB9P28065 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMB9P28065 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMB9P28065 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMB9P28065 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMB9P28065 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMB9P28065 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMB9P28065 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMB9P28065 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMB9P28065 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMB9P28065 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMB9P28065 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMB9P28065 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMB9P28065 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMB9P28065 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMB9P28065 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMB9P28065 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMB9P28065 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMB9P28065 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMB9P28065 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMB9P28065 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMB9P28065 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMB9P28065 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMB9P28065 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMB9P28065 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMB9P28065 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMB9P28065 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMB9P28065 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMB9P28065 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMB9P28065 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMB9P28065 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMB9P28065 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMB9P28065 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMB9P28065 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMB9P28065 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMB9P28065 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMB9P28065 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMB9P28065 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMB9P28065 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMB9P28065 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMB9P28065 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMB9P28065 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMB9P28065 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMB9P28065 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMB9P28065 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMB9P28065 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMB9P28065 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMB9P28065 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMB9P28065 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMB9P28065 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 195.5 ms