Protein–RNA interactions for Protein: P20851

C4BPB, C4b-binding protein beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BPBP20851 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
C4BPBP20851 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
C4BPBP20851 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
C4BPBP20851 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
C4BPBP20851 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
C4BPBP20851 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
C4BPBP20851 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
C4BPBP20851 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
C4BPBP20851 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
C4BPBP20851 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
C4BPBP20851 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
C4BPBP20851 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
C4BPBP20851 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
C4BPBP20851 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
C4BPBP20851 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
C4BPBP20851 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
C4BPBP20851 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
C4BPBP20851 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
C4BPBP20851 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
C4BPBP20851 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
C4BPBP20851 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
C4BPBP20851 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
C4BPBP20851 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
C4BPBP20851 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
C4BPBP20851 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
C4BPBP20851 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
C4BPBP20851 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
C4BPBP20851 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
C4BPBP20851 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
C4BPBP20851 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
C4BPBP20851 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
C4BPBP20851 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
C4BPBP20851 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
C4BPBP20851 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C4BPBP20851 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C4BPBP20851 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
C4BPBP20851 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C4BPBP20851 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
C4BPBP20851 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
C4BPBP20851 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
C4BPBP20851 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
C4BPBP20851 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
C4BPBP20851 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
C4BPBP20851 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C4BPBP20851 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C4BPBP20851 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
C4BPBP20851 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
C4BPBP20851 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C4BPBP20851 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
C4BPBP20851 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
C4BPBP20851 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
C4BPBP20851 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
C4BPBP20851 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
C4BPBP20851 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
C4BPBP20851 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
C4BPBP20851 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
C4BPBP20851 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
C4BPBP20851 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
C4BPBP20851 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
C4BPBP20851 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
C4BPBP20851 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
C4BPBP20851 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
C4BPBP20851 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
C4BPBP20851 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
C4BPBP20851 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
C4BPBP20851 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
C4BPBP20851 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
C4BPBP20851 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
C4BPBP20851 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
C4BPBP20851 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
C4BPBP20851 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
C4BPBP20851 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
C4BPBP20851 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
C4BPBP20851 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
C4BPBP20851 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
C4BPBP20851 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
C4BPBP20851 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
C4BPBP20851 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
C4BPBP20851 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
C4BPBP20851 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
C4BPBP20851 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
C4BPBP20851 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
C4BPBP20851 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
C4BPBP20851 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
C4BPBP20851 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
C4BPBP20851 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
C4BPBP20851 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
C4BPBP20851 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
C4BPBP20851 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
C4BPBP20851 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
C4BPBP20851 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
C4BPBP20851 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
C4BPBP20851 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
C4BPBP20851 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
C4BPBP20851 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
C4BPBP20851 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
C4BPBP20851 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
C4BPBP20851 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
C4BPBP20851 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
C4BPBP20851 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms