Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
TRHP20396 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC39.8■■■■□ 3.96
TRHP20396 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC39.8■■■■□ 3.96
TRHP20396 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC39.8■■■■□ 3.96
TRHP20396 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC39.8■■■■□ 3.96
TRHP20396 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
TRHP20396 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
TRHP20396 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC39.79■■■■□ 3.96
TRHP20396 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
TRHP20396 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
TRHP20396 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.78■■■■□ 3.96
TRHP20396 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC39.78■■■■□ 3.96
TRHP20396 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
TRHP20396 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.76■■■■□ 3.96
TRHP20396 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.76■■■■□ 3.96
TRHP20396 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC39.75■■■■□ 3.95
TRHP20396 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC39.73■■■■□ 3.95
TRHP20396 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC39.73■■■■□ 3.95
TRHP20396 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.73■■■■□ 3.95
TRHP20396 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC39.73■■■■□ 3.95
TRHP20396 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC39.72■■■■□ 3.95
TRHP20396 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC39.72■■■■□ 3.95
TRHP20396 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC39.72■■■■□ 3.95
TRHP20396 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC39.72■■■■□ 3.95
TRHP20396 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC39.72■■■■□ 3.95
TRHP20396 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
TRHP20396 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC39.72■■■■□ 3.95
TRHP20396 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC39.71■■■■□ 3.95
TRHP20396 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC39.71■■■■□ 3.95
TRHP20396 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
TRHP20396 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC39.69■■■■□ 3.94
TRHP20396 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
TRHP20396 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.68■■■■□ 3.94
TRHP20396 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC39.68■■■■□ 3.94
TRHP20396 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.68■■■■□ 3.94
TRHP20396 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
TRHP20396 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC39.67■■■■□ 3.94
TRHP20396 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
TRHP20396 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC39.65■■■■□ 3.94
TRHP20396 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
TRHP20396 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
TRHP20396 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
TRHP20396 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.94
TRHP20396 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC39.63■■■■□ 3.93
TRHP20396 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.62■■■■□ 3.93
TRHP20396 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC39.62■■■■□ 3.93
TRHP20396 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
TRHP20396 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC39.61■■■■□ 3.93
TRHP20396 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
TRHP20396 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC39.61■■■■□ 3.93
TRHP20396 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
TRHP20396 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
TRHP20396 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
TRHP20396 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC39.6■■■■□ 3.93
TRHP20396 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.6■■■■□ 3.93
TRHP20396 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
TRHP20396 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
TRHP20396 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC39.59■■■■□ 3.93
TRHP20396 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC39.59■■■■□ 3.93
TRHP20396 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.59■■■■□ 3.93
TRHP20396 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC39.59■■■■□ 3.93
TRHP20396 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC39.59■■■■□ 3.93
TRHP20396 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
TRHP20396 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
TRHP20396 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC39.58■■■■□ 3.93
TRHP20396 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC39.58■■■■□ 3.93
TRHP20396 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC39.58■■■■□ 3.93
TRHP20396 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.57■■■■□ 3.93
TRHP20396 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.56■■■■□ 3.92
TRHP20396 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC39.56■■■■□ 3.92
TRHP20396 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
TRHP20396 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
TRHP20396 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
TRHP20396 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
TRHP20396 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC39.55■■■■□ 3.92
TRHP20396 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC39.55■■■■□ 3.92
TRHP20396 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.54■■■■□ 3.92
TRHP20396 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC39.54■■■■□ 3.92
TRHP20396 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC39.54■■■■□ 3.92
TRHP20396 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
TRHP20396 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC39.53■■■■□ 3.92
TRHP20396 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC39.53■■■■□ 3.92
TRHP20396 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC39.53■■■■□ 3.92
TRHP20396 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.53■■■■□ 3.92
TRHP20396 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
TRHP20396 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
TRHP20396 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.51■■■■□ 3.92
TRHP20396 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC39.49■■■■□ 3.91
TRHP20396 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
TRHP20396 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
TRHP20396 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
TRHP20396 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC39.48■■■■□ 3.91
TRHP20396 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC39.48■■■■□ 3.91
TRHP20396 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC39.48■■■■□ 3.91
TRHP20396 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
TRHP20396 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
TRHP20396 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
TRHP20396 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.46■■■■□ 3.91
TRHP20396 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC39.46■■■■□ 3.91
TRHP20396 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC39.46■■■■□ 3.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 291 ms