Protein–RNA interactions for Protein: P0C7I6

CCDC159, Coiled-coil domain-containing protein 159, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC159P0C7I6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC159P0C7I6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC159P0C7I6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC159P0C7I6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC159P0C7I6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC159P0C7I6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC159P0C7I6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC159P0C7I6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC159P0C7I6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC159P0C7I6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC159P0C7I6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC159P0C7I6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC159P0C7I6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC159P0C7I6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC159P0C7I6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC159P0C7I6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC159P0C7I6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC159P0C7I6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC159P0C7I6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC159P0C7I6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC159P0C7I6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC159P0C7I6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC159P0C7I6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC159P0C7I6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC159P0C7I6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC159P0C7I6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC159P0C7I6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC159P0C7I6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC159P0C7I6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC159P0C7I6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC159P0C7I6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC159P0C7I6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC159P0C7I6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC159P0C7I6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC159P0C7I6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC159P0C7I6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC159P0C7I6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC159P0C7I6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC159P0C7I6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC159P0C7I6 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC159P0C7I6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC159P0C7I6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC159P0C7I6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC159P0C7I6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC159P0C7I6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC159P0C7I6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC159P0C7I6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC159P0C7I6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC159P0C7I6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC159P0C7I6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC159P0C7I6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC159P0C7I6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC159P0C7I6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC159P0C7I6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC159P0C7I6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC159P0C7I6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC159P0C7I6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC159P0C7I6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC159P0C7I6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC159P0C7I6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC159P0C7I6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC159P0C7I6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC159P0C7I6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC159P0C7I6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CCDC159P0C7I6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC159P0C7I6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC159P0C7I6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC159P0C7I6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC159P0C7I6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC159P0C7I6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC159P0C7I6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC159P0C7I6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC159P0C7I6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC159P0C7I6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC159P0C7I6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC159P0C7I6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC159P0C7I6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC159P0C7I6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC159P0C7I6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC159P0C7I6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC159P0C7I6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC159P0C7I6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC159P0C7I6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC159P0C7I6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC159P0C7I6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC159P0C7I6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC159P0C7I6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC159P0C7I6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC159P0C7I6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC159P0C7I6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC159P0C7I6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC159P0C7I6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC159P0C7I6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC159P0C7I6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC159P0C7I6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC159P0C7I6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC159P0C7I6 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC159P0C7I6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC159P0C7I6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC159P0C7I6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms