Protein–RNA interactions for Protein: P02381

VAR1, Ribosomal protein VAR1, mitochondrial, yeast

Predictions only

Length 398 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VAR1	P02381	VHT1	YGR065C	1782 nt		5.42	□□□□□ -1.54
VAR1	P02381	GPH1	YPR160W	2709 nt		5.42	□□□□□ -1.54
VAR1	P02381	PET117	YER058W	324 nt		5.42	□□□□□ -1.54
VAR1	P02381	YJL213W	YJL213W	996 nt		5.42	□□□□□ -1.54
VAR1	P02381	YMR074C	YMR074C	438 nt		5.42	□□□□□ -1.54
VAR1	P02381	MSI1	YBR195C	1269 nt		5.42	□□□□□ -1.54
VAR1	P02381	ATG22	YCL038C	1587 nt		5.42	□□□□□ -1.54
VAR1	P02381	YIL077C	YIL077C	963 nt		5.41	□□□□□ -1.54
VAR1	P02381	PAM17	YKR065C	594 nt		5.41	□□□□□ -1.54
VAR1	P02381	FUS3	YBL016W	1062 nt		5.41	□□□□□ -1.54
VAR1	P02381	SUR7	YML052W	909 nt		5.41	□□□□□ -1.54
VAR1	P02381	ECM38	YLR299W	1983 nt		5.4	□□□□□ -1.54
VAR1	P02381	YBR241C	YBR241C	1467 nt		5.4	□□□□□ -1.54
VAR1	P02381	SUN4	YNL066W	1263 nt		5.4	□□□□□ -1.54
VAR1	P02381	SDH8	YBR269C	417 nt		5.4	□□□□□ -1.54
VAR1	P02381	GSH1	YJL101C	2037 nt		5.4	□□□□□ -1.55
VAR1	P02381	ARC35	YNR035C	1029 nt		5.39	□□□□□ -1.55
VAR1	P02381	RPL43A	YPR043W	279 nt		5.39	□□□□□ -1.55
VAR1	P02381	OPI11	YPR044C	354 nt		5.39	□□□□□ -1.55
VAR1	P02381	YLL066C	YLL066C	3618 nt		5.39	□□□□□ -1.55
VAR1	P02381	TAH11	YJR046W	1815 nt		5.39	□□□□□ -1.55
VAR1	P02381	MHP1	YJL042W	4197 nt		5.38	□□□□□ -1.55
VAR1	P02381	PGI1	YBR196C	1665 nt		5.38	□□□□□ -1.55
VAR1	P02381	RPL2B	YIL018W	765 nt		5.38	□□□□□ -1.55
VAR1	P02381	CIT2	YCR005C	1383 nt		5.38	□□□□□ -1.55
VAR1	P02381	PHO3	YBR092C	1404 nt		5.38	□□□□□ -1.55
VAR1	P02381	RIO1	YOR119C	1455 nt		5.38	□□□□□ -1.55
VAR1	P02381	KNS1	YLL019C	2214 nt		5.38	□□□□□ -1.55
VAR1	P02381	YAL045C	YAL045C	309 nt		5.37	□□□□□ -1.55
VAR1	P02381	YLR358C	YLR358C	564 nt		5.37	□□□□□ -1.55
VAR1	P02381	YML122C	YML122C	381 nt		5.37	□□□□□ -1.55
VAR1	P02381	RAP1	YNL216W	2484 nt		5.37	□□□□□ -1.55
VAR1	P02381	KTR5	YNL029C	1569 nt		5.37	□□□□□ -1.55
VAR1	P02381	RIX7	YLL034C	2514 nt		5.36	□□□□□ -1.55
VAR1	P02381	DOC1	YGL240W	753 nt		5.36	□□□□□ -1.55
VAR1	P02381	ERG27	YLR100W	1044 nt		5.36	□□□□□ -1.55
VAR1	P02381	YOR343C	YOR343C	327 nt		5.36	□□□□□ -1.55
VAR1	P02381	YPR127W	YPR127W	1038 nt		5.36	□□□□□ -1.55
VAR1	P02381	DPM1	YPR183W	804 nt		5.36	□□□□□ -1.55
VAR1	P02381	ISC1	YER019W	1434 nt		5.36	□□□□□ -1.55
VAR1	P02381	SKN1	YGR143W	2316 nt		5.35	□□□□□ -1.55
VAR1	P02381	SAC6	YDR129C	1929 nt		5.35	□□□□□ -1.55
VAR1	P02381	MTR3	YGR158C	753 nt		5.35	□□□□□ -1.55
VAR1	P02381	PHO85	YPL031C	918 nt		5.35	□□□□□ -1.55
VAR1	P02381	PCS60	YBR222C	1632 nt		5.34	□□□□□ -1.55
VAR1	P02381	THR1	YHR025W	1074 nt		5.34	□□□□□ -1.55
VAR1	P02381	HDA1	YNL021W	2121 nt		5.34	□□□□□ -1.55
VAR1	P02381	SNT309	YPR101W	528 nt		5.34	□□□□□ -1.55
VAR1	P02381	HOG1	YLR113W	1308 nt		5.33	□□□□□ -1.56
VAR1	P02381	HSP12	YFL014W	330 nt		5.33	□□□□□ -1.56
VAR1	P02381	QNS1	YHR074W	2145 nt		5.33	□□□□□ -1.56
VAR1	P02381	SUB2	YDL084W	1341 nt		5.32	□□□□□ -1.56
VAR1	P02381	BUD20	YLR074C	501 nt		5.32	□□□□□ -1.56
VAR1	P02381	YFR006W	YFR006W	1608 nt		5.32	□□□□□ -1.56
VAR1	P02381	CCT3	YJL014W	1605 nt		5.32	□□□□□ -1.56
VAR1	P02381	TDP1	YBR223C	1635 nt		5.32	□□□□□ -1.56
VAR1	P02381	IRC5	YFR038W	2562 nt		5.32	□□□□□ -1.56
VAR1	P02381	DLD1	YDL174C	1764 nt		5.32	□□□□□ -1.56
VAR1	P02381	PAT1	YCR077C	2391 nt		5.31	□□□□□ -1.56
VAR1	P02381	MPE1	YKL059C	1326 nt		5.31	□□□□□ -1.56
VAR1	P02381	TUB1	YML085C	1344 nt		5.31	□□□□□ -1.56
VAR1	P02381	YPQ2	YDR352W	954 nt		5.31	□□□□□ -1.56
VAR1	P02381	DMC1	YER179W	1005 nt		5.31	□□□□□ -1.56
VAR1	P02381	FZF1	YGL254W	900 nt		5.31	□□□□□ -1.56
VAR1	P02381	YUR1	YJL139C	1287 nt		5.31	□□□□□ -1.56
VAR1	P02381	OPI8	YKR035C	642 nt		5.31	□□□□□ -1.56
VAR1	P02381	MIX17	YMR002W	471 nt		5.31	□□□□□ -1.56
VAR1	P02381	AMN1	YBR158W	1650 nt		5.31	□□□□□ -1.56
VAR1	P02381	YAL016C-A	YAL016C-A	315 nt		5.3	□□□□□ -1.56
VAR1	P02381	KAE1	YKR038C	1161 nt		5.3	□□□□□ -1.56
VAR1	P02381	RTC4	YNL254C	1206 nt		5.3	□□□□□ -1.56
VAR1	P02381	NFS1	YCL017C	1494 nt		5.3	□□□□□ -1.56
VAR1	P02381	TRP5	YGL026C	2124 nt		5.3	□□□□□ -1.56
VAR1	P02381	CSC1	YLR241W	2349 nt		5.3	□□□□□ -1.56
VAR1	P02381	RSA4	YCR072C	1548 nt		5.29	□□□□□ -1.56
VAR1	P02381	CTA1	YDR256C	1548 nt		5.29	□□□□□ -1.56
VAR1	P02381	CEM1	YER061C	1329 nt		5.28	□□□□□ -1.56
VAR1	P02381	MLS1	YNL117W	1665 nt		5.28	□□□□□ -1.56
VAR1	P02381	YCR049C	YCR049C	447 nt		5.28	□□□□□ -1.56
VAR1	P02381	HPT1	YDR399W	666 nt		5.28	□□□□□ -1.56
VAR1	P02381	ATP23	YNR020C	813 nt		5.28	□□□□□ -1.56
VAR1	P02381	DUG1	YFR044C	1446 nt		5.28	□□□□□ -1.56
VAR1	P02381	DML1	YMR211W	1428 nt		5.28	□□□□□ -1.56
VAR1	P02381	YPR204W	YPR204W	3099 nt		5.27	□□□□□ -1.57
VAR1	P02381	LSG1	YGL099W	1923 nt		5.27	□□□□□ -1.57
VAR1	P02381	TEL2	YGR099W	2067 nt		5.27	□□□□□ -1.57
VAR1	P02381	ERS1	YCR075C	783 nt		5.27	□□□□□ -1.57
VAR1	P02381	MRPL28	YDR462W	444 nt		5.27	□□□□□ -1.57
VAR1	P02381	ATF1	YOR377W	1578 nt		5.27	□□□□□ -1.57
VAR1	P02381	HBN1	YCL026C-B	582 nt		5.27	□□□□□ -1.57
VAR1	P02381	MSG5	YNL053W	1470 nt		5.26	□□□□□ -1.57
VAR1	P02381	STE13	YOR219C	2796 nt		5.26	□□□□□ -1.57
VAR1	P02381	EMW1	YNL313C	2715 nt		5.25	□□□□□ -1.57
VAR1	P02381	RGD1	YBR260C	2001 nt		5.25	□□□□□ -1.57
VAR1	P02381	TRR2	YHR106W	1029 nt		5.25	□□□□□ -1.57
VAR1	P02381	GET4	YOR164C	939 nt		5.25	□□□□□ -1.57
VAR1	P02381	YBR124W	YBR124W	360 nt		5.25	□□□□□ -1.57
VAR1	P02381	BZZ1	YHR114W	1902 nt		5.25	□□□□□ -1.57
VAR1	P02381	TUF1	YOR187W	1314 nt		5.24	□□□□□ -1.57
VAR1	P02381	PIH1	YHR034C	1035 nt		5.24	□□□□□ -1.57

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