Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TRAK2O60296 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TRAK2O60296 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TRAK2O60296 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TRAK2O60296 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TRAK2O60296 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRAK2O60296 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRAK2O60296 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRAK2O60296 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRAK2O60296 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRAK2O60296 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
TRAK2O60296 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
TRAK2O60296 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRAK2O60296 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRAK2O60296 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRAK2O60296 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRAK2O60296 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRAK2O60296 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRAK2O60296 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRAK2O60296 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRAK2O60296 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRAK2O60296 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRAK2O60296 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRAK2O60296 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRAK2O60296 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
TRAK2O60296 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRAK2O60296 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRAK2O60296 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRAK2O60296 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRAK2O60296 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRAK2O60296 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRAK2O60296 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRAK2O60296 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRAK2O60296 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRAK2O60296 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRAK2O60296 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRAK2O60296 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRAK2O60296 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRAK2O60296 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRAK2O60296 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRAK2O60296 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRAK2O60296 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRAK2O60296 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRAK2O60296 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRAK2O60296 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRAK2O60296 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRAK2O60296 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRAK2O60296 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRAK2O60296 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
TRAK2O60296 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRAK2O60296 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRAK2O60296 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRAK2O60296 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRAK2O60296 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRAK2O60296 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRAK2O60296 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRAK2O60296 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRAK2O60296 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRAK2O60296 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.2
TRAK2O60296 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRAK2O60296 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRAK2O60296 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRAK2O60296 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRAK2O60296 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRAK2O60296 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRAK2O60296 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRAK2O60296 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRAK2O60296 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRAK2O60296 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRAK2O60296 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRAK2O60296 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRAK2O60296 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRAK2O60296 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRAK2O60296 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRAK2O60296 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRAK2O60296 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRAK2O60296 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRAK2O60296 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRAK2O60296 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRAK2O60296 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRAK2O60296 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRAK2O60296 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRAK2O60296 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
TRAK2O60296 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRAK2O60296 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRAK2O60296 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRAK2O60296 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRAK2O60296 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRAK2O60296 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRAK2O60296 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRAK2O60296 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRAK2O60296 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRAK2O60296 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRAK2O60296 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
TRAK2O60296 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRAK2O60296 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRAK2O60296 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRAK2O60296 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRAK2O60296 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRAK2O60296 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms