Protein–RNA interactions for Protein: J3QRK9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QRK9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
J3QRK9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
J3QRK9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
J3QRK9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
J3QRK9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
J3QRK9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
J3QRK9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
J3QRK9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
J3QRK9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
J3QRK9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
J3QRK9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
J3QRK9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
J3QRK9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
J3QRK9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
J3QRK9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
J3QRK9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
J3QRK9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
J3QRK9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
J3QRK9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
J3QRK9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
J3QRK9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
J3QRK9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
J3QRK9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
J3QRK9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
J3QRK9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
J3QRK9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
J3QRK9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
J3QRK9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
J3QRK9 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
J3QRK9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
J3QRK9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
J3QRK9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
J3QRK9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
J3QRK9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
J3QRK9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
J3QRK9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
J3QRK9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
J3QRK9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
J3QRK9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
J3QRK9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
J3QRK9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
J3QRK9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
J3QRK9 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
J3QRK9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
J3QRK9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
J3QRK9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
J3QRK9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
J3QRK9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
J3QRK9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
J3QRK9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
J3QRK9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
J3QRK9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
J3QRK9 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
J3QRK9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
J3QRK9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
J3QRK9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
J3QRK9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
J3QRK9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
J3QRK9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
J3QRK9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
J3QRK9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
J3QRK9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
J3QRK9 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
J3QRK9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
J3QRK9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
J3QRK9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
J3QRK9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
J3QRK9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
J3QRK9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
J3QRK9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
J3QRK9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
J3QRK9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
J3QRK9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
J3QRK9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
J3QRK9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
J3QRK9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
J3QRK9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
J3QRK9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
J3QRK9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
J3QRK9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
J3QRK9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
J3QRK9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
J3QRK9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
J3QRK9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
J3QRK9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
J3QRK9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
J3QRK9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
J3QRK9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
J3QRK9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
J3QRK9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
J3QRK9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
J3QRK9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
J3QRK9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
J3QRK9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
J3QRK9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
J3QRK9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
J3QRK9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
J3QRK9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
J3QRK9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
J3QRK9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms