Protein–RNA interactions for Protein: A8MT69

CENPX, Centromere protein X, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPXA8MT69 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CENPXA8MT69 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CENPXA8MT69 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CENPXA8MT69 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CENPXA8MT69 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CENPXA8MT69 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CENPXA8MT69 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CENPXA8MT69 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CENPXA8MT69 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CENPXA8MT69 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CENPXA8MT69 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CENPXA8MT69 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CENPXA8MT69 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CENPXA8MT69 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CENPXA8MT69 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CENPXA8MT69 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CENPXA8MT69 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CENPXA8MT69 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CENPXA8MT69 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CENPXA8MT69 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPXA8MT69 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPXA8MT69 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPXA8MT69 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPXA8MT69 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPXA8MT69 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPXA8MT69 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPXA8MT69 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPXA8MT69 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPXA8MT69 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
CENPXA8MT69 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPXA8MT69 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPXA8MT69 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPXA8MT69 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPXA8MT69 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPXA8MT69 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPXA8MT69 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPXA8MT69 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPXA8MT69 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPXA8MT69 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPXA8MT69 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPXA8MT69 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPXA8MT69 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPXA8MT69 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPXA8MT69 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPXA8MT69 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CENPXA8MT69 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CENPXA8MT69 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CENPXA8MT69 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CENPXA8MT69 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CENPXA8MT69 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CENPXA8MT69 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPXA8MT69 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPXA8MT69 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPXA8MT69 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPXA8MT69 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPXA8MT69 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPXA8MT69 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CENPXA8MT69 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CENPXA8MT69 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPXA8MT69 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPXA8MT69 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPXA8MT69 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPXA8MT69 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPXA8MT69 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPXA8MT69 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPXA8MT69 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPXA8MT69 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPXA8MT69 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPXA8MT69 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPXA8MT69 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPXA8MT69 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPXA8MT69 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPXA8MT69 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPXA8MT69 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPXA8MT69 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPXA8MT69 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPXA8MT69 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPXA8MT69 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CENPXA8MT69 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CENPXA8MT69 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CENPXA8MT69 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CENPXA8MT69 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CENPXA8MT69 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CENPXA8MT69 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CENPXA8MT69 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPXA8MT69 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPXA8MT69 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPXA8MT69 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPXA8MT69 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CENPXA8MT69 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CENPXA8MT69 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CENPXA8MT69 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CENPXA8MT69 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CENPXA8MT69 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CENPXA8MT69 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CENPXA8MT69 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CENPXA8MT69 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CENPXA8MT69 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CENPXA8MT69 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CENPXA8MT69 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms