Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
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HIF1AQ16665 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
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