Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q6R5

CRIP3, Cysteine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP3Q6Q6R5 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms