Protein–RNA interactions for Protein: O14618

CCS, Copper chaperone for superoxide dismutase, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSO14618 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCSO14618 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCSO14618 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCSO14618 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCSO14618 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCSO14618 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCSO14618 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCSO14618 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCSO14618 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCSO14618 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCSO14618 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCSO14618 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CCSO14618 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CCSO14618 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCSO14618 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCSO14618 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCSO14618 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCSO14618 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCSO14618 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCSO14618 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCSO14618 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCSO14618 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCSO14618 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCSO14618 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCSO14618 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCSO14618 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCSO14618 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCSO14618 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCSO14618 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CCSO14618 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCSO14618 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCSO14618 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCSO14618 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCSO14618 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCSO14618 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCSO14618 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCSO14618 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCSO14618 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCSO14618 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCSO14618 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCSO14618 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCSO14618 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCSO14618 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCSO14618 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCSO14618 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCSO14618 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCSO14618 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCSO14618 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCSO14618 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCSO14618 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCSO14618 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCSO14618 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CCSO14618 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCSO14618 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCSO14618 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCSO14618 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCSO14618 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCSO14618 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCSO14618 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCSO14618 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCSO14618 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCSO14618 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCSO14618 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCSO14618 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCSO14618 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCSO14618 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCSO14618 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCSO14618 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCSO14618 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCSO14618 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCSO14618 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCSO14618 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCSO14618 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCSO14618 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCSO14618 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCSO14618 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCSO14618 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCSO14618 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCSO14618 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCSO14618 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCSO14618 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCSO14618 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCSO14618 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCSO14618 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCSO14618 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCSO14618 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCSO14618 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCSO14618 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCSO14618 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCSO14618 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCSO14618 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCSO14618 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCSO14618 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCSO14618 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCSO14618 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCSO14618 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCSO14618 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCSO14618 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCSO14618 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCSO14618 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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