Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q6R5

CRIP3, Cysteine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP3Q6Q6R5 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms