Protein–RNA interactions for Protein: P53992

SEC24C, Protein transport protein Sec24C, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24CP53992 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms