Protein–RNA interactions for Protein: Q53H54

TRMT12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT12Q53H54 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TRMT12Q53H54 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRMT12Q53H54 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRMT12Q53H54 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRMT12Q53H54 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRMT12Q53H54 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRMT12Q53H54 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRMT12Q53H54 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRMT12Q53H54 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRMT12Q53H54 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TRMT12Q53H54 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRMT12Q53H54 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRMT12Q53H54 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRMT12Q53H54 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRMT12Q53H54 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRMT12Q53H54 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRMT12Q53H54 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRMT12Q53H54 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRMT12Q53H54 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRMT12Q53H54 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRMT12Q53H54 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRMT12Q53H54 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRMT12Q53H54 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRMT12Q53H54 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TRMT12Q53H54 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRMT12Q53H54 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRMT12Q53H54 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRMT12Q53H54 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TRMT12Q53H54 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRMT12Q53H54 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRMT12Q53H54 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TRMT12Q53H54 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRMT12Q53H54 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRMT12Q53H54 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TRMT12Q53H54 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRMT12Q53H54 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TRMT12Q53H54 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRMT12Q53H54 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TRMT12Q53H54 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRMT12Q53H54 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRMT12Q53H54 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TRMT12Q53H54 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRMT12Q53H54 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRMT12Q53H54 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRMT12Q53H54 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRMT12Q53H54 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRMT12Q53H54 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRMT12Q53H54 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRMT12Q53H54 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRMT12Q53H54 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRMT12Q53H54 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRMT12Q53H54 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRMT12Q53H54 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRMT12Q53H54 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRMT12Q53H54 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRMT12Q53H54 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRMT12Q53H54 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRMT12Q53H54 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRMT12Q53H54 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRMT12Q53H54 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TRMT12Q53H54 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRMT12Q53H54 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRMT12Q53H54 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRMT12Q53H54 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRMT12Q53H54 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRMT12Q53H54 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRMT12Q53H54 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TRMT12Q53H54 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRMT12Q53H54 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRMT12Q53H54 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRMT12Q53H54 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRMT12Q53H54 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRMT12Q53H54 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TRMT12Q53H54 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRMT12Q53H54 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRMT12Q53H54 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRMT12Q53H54 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRMT12Q53H54 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRMT12Q53H54 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRMT12Q53H54 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRMT12Q53H54 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRMT12Q53H54 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRMT12Q53H54 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRMT12Q53H54 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRMT12Q53H54 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRMT12Q53H54 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRMT12Q53H54 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRMT12Q53H54 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRMT12Q53H54 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRMT12Q53H54 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRMT12Q53H54 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRMT12Q53H54 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRMT12Q53H54 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRMT12Q53H54 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRMT12Q53H54 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRMT12Q53H54 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRMT12Q53H54 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRMT12Q53H54 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRMT12Q53H54 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRMT12Q53H54 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms