Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULI1

NWD2, NACHT and WD repeat domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NWD2Q9ULI1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
NWD2Q9ULI1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
NWD2Q9ULI1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
NWD2Q9ULI1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
NWD2Q9ULI1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
NWD2Q9ULI1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
NWD2Q9ULI1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
NWD2Q9ULI1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
NWD2Q9ULI1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
NWD2Q9ULI1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
NWD2Q9ULI1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
NWD2Q9ULI1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
NWD2Q9ULI1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
NWD2Q9ULI1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
NWD2Q9ULI1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
NWD2Q9ULI1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
NWD2Q9ULI1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
NWD2Q9ULI1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
NWD2Q9ULI1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
NWD2Q9ULI1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
NWD2Q9ULI1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
NWD2Q9ULI1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
NWD2Q9ULI1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
NWD2Q9ULI1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC33.87■■■■□ 3.01
NWD2Q9ULI1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
NWD2Q9ULI1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
NWD2Q9ULI1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC33.86■■■■□ 3.01
NWD2Q9ULI1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
NWD2Q9ULI1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
NWD2Q9ULI1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
NWD2Q9ULI1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
NWD2Q9ULI1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
NWD2Q9ULI1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
NWD2Q9ULI1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC33.84■■■■□ 3.01
NWD2Q9ULI1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
NWD2Q9ULI1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
NWD2Q9ULI1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
NWD2Q9ULI1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
NWD2Q9ULI1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
NWD2Q9ULI1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
NWD2Q9ULI1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
NWD2Q9ULI1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
NWD2Q9ULI1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
NWD2Q9ULI1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
NWD2Q9ULI1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
NWD2Q9ULI1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC33.82■■■■□ 3
NWD2Q9ULI1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC33.82■■■■□ 3
NWD2Q9ULI1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
NWD2Q9ULI1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
NWD2Q9ULI1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
NWD2Q9ULI1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
NWD2Q9ULI1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
NWD2Q9ULI1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
NWD2Q9ULI1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
NWD2Q9ULI1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
NWD2Q9ULI1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
NWD2Q9ULI1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
NWD2Q9ULI1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
NWD2Q9ULI1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
NWD2Q9ULI1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
NWD2Q9ULI1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC33.79■■■■□ 3
NWD2Q9ULI1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
NWD2Q9ULI1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC33.78■■■■□ 3
NWD2Q9ULI1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
NWD2Q9ULI1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
NWD2Q9ULI1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
NWD2Q9ULI1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
NWD2Q9ULI1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC33.77■■■■□ 3
NWD2Q9ULI1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC33.76■■■■□ 3
NWD2Q9ULI1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
NWD2Q9ULI1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
NWD2Q9ULI1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
NWD2Q9ULI1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
NWD2Q9ULI1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
NWD2Q9ULI1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
NWD2Q9ULI1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
NWD2Q9ULI1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
NWD2Q9ULI1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
NWD2Q9ULI1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
NWD2Q9ULI1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
NWD2Q9ULI1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
NWD2Q9ULI1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
NWD2Q9ULI1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
NWD2Q9ULI1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
NWD2Q9ULI1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
NWD2Q9ULI1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
NWD2Q9ULI1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
NWD2Q9ULI1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
NWD2Q9ULI1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
NWD2Q9ULI1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
NWD2Q9ULI1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
NWD2Q9ULI1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
NWD2Q9ULI1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
NWD2Q9ULI1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
NWD2Q9ULI1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
NWD2Q9ULI1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC33.69■■■□□ 2.98
NWD2Q9ULI1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
NWD2Q9ULI1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC33.67■■■□□ 2.98
NWD2Q9ULI1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
NWD2Q9ULI1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms