Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E7

PCDH10, Protocadherin-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH10Q9P2E7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PCDH10Q9P2E7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PCDH10Q9P2E7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PCDH10Q9P2E7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PCDH10Q9P2E7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PCDH10Q9P2E7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PCDH10Q9P2E7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PCDH10Q9P2E7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PCDH10Q9P2E7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PCDH10Q9P2E7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PCDH10Q9P2E7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PCDH10Q9P2E7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PCDH10Q9P2E7 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PCDH10Q9P2E7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PCDH10Q9P2E7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PCDH10Q9P2E7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PCDH10Q9P2E7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PCDH10Q9P2E7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PCDH10Q9P2E7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PCDH10Q9P2E7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PCDH10Q9P2E7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PCDH10Q9P2E7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PCDH10Q9P2E7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PCDH10Q9P2E7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PCDH10Q9P2E7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PCDH10Q9P2E7 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PCDH10Q9P2E7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PCDH10Q9P2E7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PCDH10Q9P2E7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PCDH10Q9P2E7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PCDH10Q9P2E7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PCDH10Q9P2E7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PCDH10Q9P2E7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PCDH10Q9P2E7 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PCDH10Q9P2E7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PCDH10Q9P2E7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
PCDH10Q9P2E7 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
PCDH10Q9P2E7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PCDH10Q9P2E7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PCDH10Q9P2E7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PCDH10Q9P2E7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PCDH10Q9P2E7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PCDH10Q9P2E7 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PCDH10Q9P2E7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PCDH10Q9P2E7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PCDH10Q9P2E7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PCDH10Q9P2E7 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PCDH10Q9P2E7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PCDH10Q9P2E7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PCDH10Q9P2E7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PCDH10Q9P2E7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PCDH10Q9P2E7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PCDH10Q9P2E7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PCDH10Q9P2E7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PCDH10Q9P2E7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PCDH10Q9P2E7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PCDH10Q9P2E7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PCDH10Q9P2E7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PCDH10Q9P2E7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PCDH10Q9P2E7 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PCDH10Q9P2E7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PCDH10Q9P2E7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PCDH10Q9P2E7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PCDH10Q9P2E7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PCDH10Q9P2E7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PCDH10Q9P2E7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PCDH10Q9P2E7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PCDH10Q9P2E7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PCDH10Q9P2E7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PCDH10Q9P2E7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PCDH10Q9P2E7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PCDH10Q9P2E7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PCDH10Q9P2E7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PCDH10Q9P2E7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PCDH10Q9P2E7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PCDH10Q9P2E7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PCDH10Q9P2E7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PCDH10Q9P2E7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PCDH10Q9P2E7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PCDH10Q9P2E7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PCDH10Q9P2E7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PCDH10Q9P2E7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PCDH10Q9P2E7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PCDH10Q9P2E7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PCDH10Q9P2E7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PCDH10Q9P2E7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
PCDH10Q9P2E7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PCDH10Q9P2E7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PCDH10Q9P2E7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PCDH10Q9P2E7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PCDH10Q9P2E7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PCDH10Q9P2E7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PCDH10Q9P2E7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
PCDH10Q9P2E7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PCDH10Q9P2E7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PCDH10Q9P2E7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PCDH10Q9P2E7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PCDH10Q9P2E7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PCDH10Q9P2E7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PCDH10Q9P2E7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 147 ms