Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ5

PGPEP1, Pyroglutamyl-peptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1Q9NXJ5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PGPEP1Q9NXJ5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PGPEP1Q9NXJ5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PGPEP1Q9NXJ5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PGPEP1Q9NXJ5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PGPEP1Q9NXJ5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PGPEP1Q9NXJ5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PGPEP1Q9NXJ5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PGPEP1Q9NXJ5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PGPEP1Q9NXJ5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PGPEP1Q9NXJ5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PGPEP1Q9NXJ5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PGPEP1Q9NXJ5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PGPEP1Q9NXJ5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PGPEP1Q9NXJ5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PGPEP1Q9NXJ5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PGPEP1Q9NXJ5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PGPEP1Q9NXJ5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PGPEP1Q9NXJ5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PGPEP1Q9NXJ5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PGPEP1Q9NXJ5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PGPEP1Q9NXJ5 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PGPEP1Q9NXJ5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PGPEP1Q9NXJ5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PGPEP1Q9NXJ5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PGPEP1Q9NXJ5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PGPEP1Q9NXJ5 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PGPEP1Q9NXJ5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PGPEP1Q9NXJ5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PGPEP1Q9NXJ5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PGPEP1Q9NXJ5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PGPEP1Q9NXJ5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PGPEP1Q9NXJ5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PGPEP1Q9NXJ5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PGPEP1Q9NXJ5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PGPEP1Q9NXJ5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PGPEP1Q9NXJ5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PGPEP1Q9NXJ5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PGPEP1Q9NXJ5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PGPEP1Q9NXJ5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PGPEP1Q9NXJ5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PGPEP1Q9NXJ5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PGPEP1Q9NXJ5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PGPEP1Q9NXJ5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PGPEP1Q9NXJ5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PGPEP1Q9NXJ5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PGPEP1Q9NXJ5 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PGPEP1Q9NXJ5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PGPEP1Q9NXJ5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PGPEP1Q9NXJ5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PGPEP1Q9NXJ5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PGPEP1Q9NXJ5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PGPEP1Q9NXJ5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PGPEP1Q9NXJ5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PGPEP1Q9NXJ5 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PGPEP1Q9NXJ5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PGPEP1Q9NXJ5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PGPEP1Q9NXJ5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PGPEP1Q9NXJ5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PGPEP1Q9NXJ5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PGPEP1Q9NXJ5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PGPEP1Q9NXJ5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PGPEP1Q9NXJ5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PGPEP1Q9NXJ5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PGPEP1Q9NXJ5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PGPEP1Q9NXJ5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PGPEP1Q9NXJ5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PGPEP1Q9NXJ5 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PGPEP1Q9NXJ5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PGPEP1Q9NXJ5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PGPEP1Q9NXJ5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PGPEP1Q9NXJ5 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PGPEP1Q9NXJ5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PGPEP1Q9NXJ5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PGPEP1Q9NXJ5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PGPEP1Q9NXJ5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PGPEP1Q9NXJ5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PGPEP1Q9NXJ5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PGPEP1Q9NXJ5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PGPEP1Q9NXJ5 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PGPEP1Q9NXJ5 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PGPEP1Q9NXJ5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PGPEP1Q9NXJ5 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PGPEP1Q9NXJ5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PGPEP1Q9NXJ5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PGPEP1Q9NXJ5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PGPEP1Q9NXJ5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PGPEP1Q9NXJ5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PGPEP1Q9NXJ5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PGPEP1Q9NXJ5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PGPEP1Q9NXJ5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PGPEP1Q9NXJ5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PGPEP1Q9NXJ5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PGPEP1Q9NXJ5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PGPEP1Q9NXJ5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PGPEP1Q9NXJ5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PGPEP1Q9NXJ5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PGPEP1Q9NXJ5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PGPEP1Q9NXJ5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms