Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSJ1

ZNF355P, Putative zinc finger protein 355P, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF355PQ9NSJ1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF355PQ9NSJ1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF355PQ9NSJ1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF355PQ9NSJ1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF355PQ9NSJ1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF355PQ9NSJ1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF355PQ9NSJ1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF355PQ9NSJ1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF355PQ9NSJ1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF355PQ9NSJ1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF355PQ9NSJ1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF355PQ9NSJ1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF355PQ9NSJ1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF355PQ9NSJ1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF355PQ9NSJ1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF355PQ9NSJ1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF355PQ9NSJ1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF355PQ9NSJ1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF355PQ9NSJ1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF355PQ9NSJ1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF355PQ9NSJ1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF355PQ9NSJ1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF355PQ9NSJ1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF355PQ9NSJ1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF355PQ9NSJ1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF355PQ9NSJ1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF355PQ9NSJ1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF355PQ9NSJ1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF355PQ9NSJ1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF355PQ9NSJ1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF355PQ9NSJ1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF355PQ9NSJ1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF355PQ9NSJ1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF355PQ9NSJ1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF355PQ9NSJ1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF355PQ9NSJ1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF355PQ9NSJ1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF355PQ9NSJ1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF355PQ9NSJ1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF355PQ9NSJ1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF355PQ9NSJ1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF355PQ9NSJ1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF355PQ9NSJ1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF355PQ9NSJ1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF355PQ9NSJ1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF355PQ9NSJ1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF355PQ9NSJ1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF355PQ9NSJ1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF355PQ9NSJ1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF355PQ9NSJ1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF355PQ9NSJ1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF355PQ9NSJ1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF355PQ9NSJ1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF355PQ9NSJ1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF355PQ9NSJ1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF355PQ9NSJ1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF355PQ9NSJ1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF355PQ9NSJ1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF355PQ9NSJ1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF355PQ9NSJ1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF355PQ9NSJ1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF355PQ9NSJ1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF355PQ9NSJ1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF355PQ9NSJ1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF355PQ9NSJ1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF355PQ9NSJ1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF355PQ9NSJ1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF355PQ9NSJ1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF355PQ9NSJ1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF355PQ9NSJ1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF355PQ9NSJ1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF355PQ9NSJ1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF355PQ9NSJ1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF355PQ9NSJ1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ZNF355PQ9NSJ1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ZNF355PQ9NSJ1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
ZNF355PQ9NSJ1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ZNF355PQ9NSJ1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ZNF355PQ9NSJ1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ZNF355PQ9NSJ1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ZNF355PQ9NSJ1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF355PQ9NSJ1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF355PQ9NSJ1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF355PQ9NSJ1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF355PQ9NSJ1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF355PQ9NSJ1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF355PQ9NSJ1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF355PQ9NSJ1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF355PQ9NSJ1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF355PQ9NSJ1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF355PQ9NSJ1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF355PQ9NSJ1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF355PQ9NSJ1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF355PQ9NSJ1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF355PQ9NSJ1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF355PQ9NSJ1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF355PQ9NSJ1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF355PQ9NSJ1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF355PQ9NSJ1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF355PQ9NSJ1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms