Protein–RNA interactions for Protein: Q99590

SCAF11, Protein SCAF11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF11Q99590 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
SCAF11Q99590 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC36.46■■■■□ 3.43
SCAF11Q99590 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
SCAF11Q99590 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
SCAF11Q99590 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC36.46■■■■□ 3.43
SCAF11Q99590 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
SCAF11Q99590 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
SCAF11Q99590 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
SCAF11Q99590 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
SCAF11Q99590 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
SCAF11Q99590 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
SCAF11Q99590 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
SCAF11Q99590 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
SCAF11Q99590 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
SCAF11Q99590 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
SCAF11Q99590 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
SCAF11Q99590 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
SCAF11Q99590 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
SCAF11Q99590 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
SCAF11Q99590 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
SCAF11Q99590 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
SCAF11Q99590 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
SCAF11Q99590 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
SCAF11Q99590 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
SCAF11Q99590 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
SCAF11Q99590 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
SCAF11Q99590 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
SCAF11Q99590 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
SCAF11Q99590 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
SCAF11Q99590 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC36.4■■■■□ 3.42
SCAF11Q99590 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC36.4■■■■□ 3.42
SCAF11Q99590 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
SCAF11Q99590 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
SCAF11Q99590 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
SCAF11Q99590 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
SCAF11Q99590 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC36.38■■■■□ 3.41
SCAF11Q99590 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
SCAF11Q99590 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
SCAF11Q99590 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
SCAF11Q99590 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
SCAF11Q99590 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
SCAF11Q99590 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
SCAF11Q99590 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
SCAF11Q99590 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
SCAF11Q99590 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
SCAF11Q99590 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.35■■■■□ 3.41
SCAF11Q99590 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
SCAF11Q99590 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
SCAF11Q99590 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
SCAF11Q99590 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
SCAF11Q99590 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
SCAF11Q99590 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
SCAF11Q99590 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
SCAF11Q99590 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
SCAF11Q99590 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.41
SCAF11Q99590 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC36.32■■■■□ 3.41
SCAF11Q99590 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.41
SCAF11Q99590 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
SCAF11Q99590 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
SCAF11Q99590 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
SCAF11Q99590 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
SCAF11Q99590 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
SCAF11Q99590 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
SCAF11Q99590 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
SCAF11Q99590 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
SCAF11Q99590 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
SCAF11Q99590 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
SCAF11Q99590 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
SCAF11Q99590 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
SCAF11Q99590 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
SCAF11Q99590 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
SCAF11Q99590 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
SCAF11Q99590 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
SCAF11Q99590 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC36.26■■■■□ 3.4
SCAF11Q99590 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
SCAF11Q99590 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
SCAF11Q99590 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
SCAF11Q99590 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
SCAF11Q99590 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
SCAF11Q99590 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
SCAF11Q99590 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
SCAF11Q99590 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC36.24■■■■□ 3.39
SCAF11Q99590 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
SCAF11Q99590 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
SCAF11Q99590 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
SCAF11Q99590 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
SCAF11Q99590 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
SCAF11Q99590 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
SCAF11Q99590 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
SCAF11Q99590 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
SCAF11Q99590 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
SCAF11Q99590 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
SCAF11Q99590 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC36.21■■■■□ 3.39
SCAF11Q99590 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
SCAF11Q99590 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
SCAF11Q99590 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
SCAF11Q99590 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
SCAF11Q99590 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
SCAF11Q99590 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
SCAF11Q99590 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms