Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAT1

POMGNT2, Protein O-linked-mannose beta-1,4-N-acetylglucosaminyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMGNT2Q8NAT1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POMGNT2Q8NAT1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
POMGNT2Q8NAT1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
POMGNT2Q8NAT1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
POMGNT2Q8NAT1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
POMGNT2Q8NAT1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
POMGNT2Q8NAT1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
POMGNT2Q8NAT1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
POMGNT2Q8NAT1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
POMGNT2Q8NAT1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POMGNT2Q8NAT1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POMGNT2Q8NAT1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POMGNT2Q8NAT1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POMGNT2Q8NAT1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POMGNT2Q8NAT1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POMGNT2Q8NAT1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POMGNT2Q8NAT1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POMGNT2Q8NAT1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POMGNT2Q8NAT1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POMGNT2Q8NAT1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POMGNT2Q8NAT1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POMGNT2Q8NAT1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POMGNT2Q8NAT1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POMGNT2Q8NAT1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POMGNT2Q8NAT1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POMGNT2Q8NAT1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POMGNT2Q8NAT1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POMGNT2Q8NAT1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POMGNT2Q8NAT1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
POMGNT2Q8NAT1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
POMGNT2Q8NAT1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POMGNT2Q8NAT1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POMGNT2Q8NAT1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POMGNT2Q8NAT1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POMGNT2Q8NAT1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POMGNT2Q8NAT1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POMGNT2Q8NAT1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POMGNT2Q8NAT1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POMGNT2Q8NAT1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POMGNT2Q8NAT1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POMGNT2Q8NAT1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POMGNT2Q8NAT1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POMGNT2Q8NAT1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POMGNT2Q8NAT1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POMGNT2Q8NAT1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POMGNT2Q8NAT1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POMGNT2Q8NAT1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POMGNT2Q8NAT1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POMGNT2Q8NAT1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POMGNT2Q8NAT1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POMGNT2Q8NAT1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POMGNT2Q8NAT1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POMGNT2Q8NAT1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
POMGNT2Q8NAT1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
POMGNT2Q8NAT1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POMGNT2Q8NAT1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POMGNT2Q8NAT1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POMGNT2Q8NAT1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POMGNT2Q8NAT1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POMGNT2Q8NAT1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POMGNT2Q8NAT1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
POMGNT2Q8NAT1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POMGNT2Q8NAT1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POMGNT2Q8NAT1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POMGNT2Q8NAT1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
POMGNT2Q8NAT1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
POMGNT2Q8NAT1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POMGNT2Q8NAT1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POMGNT2Q8NAT1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POMGNT2Q8NAT1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POMGNT2Q8NAT1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POMGNT2Q8NAT1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POMGNT2Q8NAT1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POMGNT2Q8NAT1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POMGNT2Q8NAT1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POMGNT2Q8NAT1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POMGNT2Q8NAT1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POMGNT2Q8NAT1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POMGNT2Q8NAT1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POMGNT2Q8NAT1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POMGNT2Q8NAT1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POMGNT2Q8NAT1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POMGNT2Q8NAT1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POMGNT2Q8NAT1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POMGNT2Q8NAT1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POMGNT2Q8NAT1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
POMGNT2Q8NAT1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
POMGNT2Q8NAT1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POMGNT2Q8NAT1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POMGNT2Q8NAT1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POMGNT2Q8NAT1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POMGNT2Q8NAT1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POMGNT2Q8NAT1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POMGNT2Q8NAT1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POMGNT2Q8NAT1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POMGNT2Q8NAT1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POMGNT2Q8NAT1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POMGNT2Q8NAT1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POMGNT2Q8NAT1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POMGNT2Q8NAT1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms