Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR2

NLRC3, NLR family CARD domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,065 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC3Q7RTR2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NLRC3Q7RTR2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NLRC3Q7RTR2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NLRC3Q7RTR2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NLRC3Q7RTR2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NLRC3Q7RTR2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NLRC3Q7RTR2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLRC3Q7RTR2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NLRC3Q7RTR2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLRC3Q7RTR2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLRC3Q7RTR2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLRC3Q7RTR2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLRC3Q7RTR2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLRC3Q7RTR2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLRC3Q7RTR2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLRC3Q7RTR2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NLRC3Q7RTR2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NLRC3Q7RTR2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NLRC3Q7RTR2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NLRC3Q7RTR2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NLRC3Q7RTR2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NLRC3Q7RTR2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NLRC3Q7RTR2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NLRC3Q7RTR2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NLRC3Q7RTR2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NLRC3Q7RTR2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NLRC3Q7RTR2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NLRC3Q7RTR2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NLRC3Q7RTR2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NLRC3Q7RTR2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NLRC3Q7RTR2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NLRC3Q7RTR2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NLRC3Q7RTR2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NLRC3Q7RTR2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NLRC3Q7RTR2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NLRC3Q7RTR2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NLRC3Q7RTR2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NLRC3Q7RTR2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NLRC3Q7RTR2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NLRC3Q7RTR2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NLRC3Q7RTR2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NLRC3Q7RTR2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NLRC3Q7RTR2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
NLRC3Q7RTR2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NLRC3Q7RTR2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NLRC3Q7RTR2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NLRC3Q7RTR2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NLRC3Q7RTR2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NLRC3Q7RTR2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NLRC3Q7RTR2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NLRC3Q7RTR2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NLRC3Q7RTR2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NLRC3Q7RTR2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NLRC3Q7RTR2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NLRC3Q7RTR2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NLRC3Q7RTR2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NLRC3Q7RTR2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NLRC3Q7RTR2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NLRC3Q7RTR2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NLRC3Q7RTR2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NLRC3Q7RTR2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NLRC3Q7RTR2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NLRC3Q7RTR2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NLRC3Q7RTR2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NLRC3Q7RTR2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NLRC3Q7RTR2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NLRC3Q7RTR2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NLRC3Q7RTR2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NLRC3Q7RTR2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NLRC3Q7RTR2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NLRC3Q7RTR2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NLRC3Q7RTR2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NLRC3Q7RTR2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLRC3Q7RTR2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLRC3Q7RTR2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLRC3Q7RTR2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLRC3Q7RTR2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLRC3Q7RTR2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLRC3Q7RTR2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLRC3Q7RTR2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NLRC3Q7RTR2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NLRC3Q7RTR2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NLRC3Q7RTR2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NLRC3Q7RTR2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NLRC3Q7RTR2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NLRC3Q7RTR2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NLRC3Q7RTR2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NLRC3Q7RTR2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NLRC3Q7RTR2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLRC3Q7RTR2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLRC3Q7RTR2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLRC3Q7RTR2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLRC3Q7RTR2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLRC3Q7RTR2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLRC3Q7RTR2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRC3Q7RTR2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRC3Q7RTR2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRC3Q7RTR2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRC3Q7RTR2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRC3Q7RTR2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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