Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4F4

ZFYVE27, Protrudin, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFYVE27Q5T4F4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZFYVE27Q5T4F4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZFYVE27Q5T4F4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZFYVE27Q5T4F4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZFYVE27Q5T4F4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZFYVE27Q5T4F4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZFYVE27Q5T4F4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZFYVE27Q5T4F4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZFYVE27Q5T4F4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZFYVE27Q5T4F4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZFYVE27Q5T4F4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZFYVE27Q5T4F4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZFYVE27Q5T4F4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZFYVE27Q5T4F4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZFYVE27Q5T4F4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZFYVE27Q5T4F4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZFYVE27Q5T4F4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZFYVE27Q5T4F4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZFYVE27Q5T4F4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZFYVE27Q5T4F4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZFYVE27Q5T4F4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZFYVE27Q5T4F4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZFYVE27Q5T4F4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZFYVE27Q5T4F4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZFYVE27Q5T4F4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZFYVE27Q5T4F4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZFYVE27Q5T4F4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZFYVE27Q5T4F4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZFYVE27Q5T4F4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZFYVE27Q5T4F4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZFYVE27Q5T4F4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZFYVE27Q5T4F4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZFYVE27Q5T4F4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZFYVE27Q5T4F4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZFYVE27Q5T4F4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZFYVE27Q5T4F4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZFYVE27Q5T4F4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZFYVE27Q5T4F4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZFYVE27Q5T4F4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZFYVE27Q5T4F4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZFYVE27Q5T4F4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZFYVE27Q5T4F4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZFYVE27Q5T4F4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZFYVE27Q5T4F4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZFYVE27Q5T4F4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZFYVE27Q5T4F4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZFYVE27Q5T4F4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZFYVE27Q5T4F4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZFYVE27Q5T4F4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZFYVE27Q5T4F4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZFYVE27Q5T4F4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZFYVE27Q5T4F4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZFYVE27Q5T4F4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZFYVE27Q5T4F4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZFYVE27Q5T4F4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZFYVE27Q5T4F4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZFYVE27Q5T4F4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZFYVE27Q5T4F4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZFYVE27Q5T4F4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZFYVE27Q5T4F4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZFYVE27Q5T4F4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZFYVE27Q5T4F4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZFYVE27Q5T4F4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZFYVE27Q5T4F4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZFYVE27Q5T4F4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZFYVE27Q5T4F4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZFYVE27Q5T4F4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZFYVE27Q5T4F4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZFYVE27Q5T4F4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZFYVE27Q5T4F4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ZFYVE27Q5T4F4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZFYVE27Q5T4F4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZFYVE27Q5T4F4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZFYVE27Q5T4F4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZFYVE27Q5T4F4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZFYVE27Q5T4F4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZFYVE27Q5T4F4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZFYVE27Q5T4F4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZFYVE27Q5T4F4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZFYVE27Q5T4F4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZFYVE27Q5T4F4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZFYVE27Q5T4F4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZFYVE27Q5T4F4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZFYVE27Q5T4F4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZFYVE27Q5T4F4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZFYVE27Q5T4F4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZFYVE27Q5T4F4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZFYVE27Q5T4F4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZFYVE27Q5T4F4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZFYVE27Q5T4F4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZFYVE27Q5T4F4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
ZFYVE27Q5T4F4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ZFYVE27Q5T4F4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ZFYVE27Q5T4F4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZFYVE27Q5T4F4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZFYVE27Q5T4F4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZFYVE27Q5T4F4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZFYVE27Q5T4F4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZFYVE27Q5T4F4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZFYVE27Q5T4F4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms