Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
FRMPD1Q5SYB0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC38.48■■■■□ 3.75
FRMPD1Q5SYB0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
FRMPD1Q5SYB0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC38.47■■■■□ 3.75
FRMPD1Q5SYB0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
FRMPD1Q5SYB0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.46■■■■□ 3.75
FRMPD1Q5SYB0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
FRMPD1Q5SYB0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC38.46■■■■□ 3.75
FRMPD1Q5SYB0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
FRMPD1Q5SYB0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.45■■■■□ 3.75
FRMPD1Q5SYB0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC38.45■■■■□ 3.75
FRMPD1Q5SYB0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC38.44■■■■□ 3.74
FRMPD1Q5SYB0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC38.44■■■■□ 3.74
FRMPD1Q5SYB0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC38.44■■■■□ 3.74
FRMPD1Q5SYB0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
FRMPD1Q5SYB0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC38.43■■■■□ 3.74
FRMPD1Q5SYB0 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC38.43■■■■□ 3.74
FRMPD1Q5SYB0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC38.42■■■■□ 3.74
FRMPD1Q5SYB0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC38.42■■■■□ 3.74
FRMPD1Q5SYB0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
FRMPD1Q5SYB0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC38.41■■■■□ 3.74
FRMPD1Q5SYB0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC38.41■■■■□ 3.74
FRMPD1Q5SYB0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
FRMPD1Q5SYB0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
FRMPD1Q5SYB0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
FRMPD1Q5SYB0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
FRMPD1Q5SYB0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
FRMPD1Q5SYB0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
FRMPD1Q5SYB0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
FRMPD1Q5SYB0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC38.4■■■■□ 3.74
FRMPD1Q5SYB0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
FRMPD1Q5SYB0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC38.4■■■■□ 3.74
FRMPD1Q5SYB0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
FRMPD1Q5SYB0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
FRMPD1Q5SYB0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC38.39■■■■□ 3.74
FRMPD1Q5SYB0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.39■■■■□ 3.74
FRMPD1Q5SYB0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC38.39■■■■□ 3.74
FRMPD1Q5SYB0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
FRMPD1Q5SYB0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.73
FRMPD1Q5SYB0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
FRMPD1Q5SYB0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
FRMPD1Q5SYB0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
FRMPD1Q5SYB0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.37■■■■□ 3.73
FRMPD1Q5SYB0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
FRMPD1Q5SYB0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
FRMPD1Q5SYB0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
FRMPD1Q5SYB0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.36■■■■□ 3.73
FRMPD1Q5SYB0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
FRMPD1Q5SYB0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
FRMPD1Q5SYB0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC38.36■■■■□ 3.73
FRMPD1Q5SYB0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
FRMPD1Q5SYB0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC38.35■■■■□ 3.73
FRMPD1Q5SYB0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC38.35■■■■□ 3.73
FRMPD1Q5SYB0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
FRMPD1Q5SYB0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC38.34■■■■□ 3.73
FRMPD1Q5SYB0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
FRMPD1Q5SYB0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
FRMPD1Q5SYB0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC38.34■■■■□ 3.73
FRMPD1Q5SYB0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC38.33■■■■□ 3.73
FRMPD1Q5SYB0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC38.33■■■■□ 3.73
FRMPD1Q5SYB0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC38.32■■■■□ 3.73
FRMPD1Q5SYB0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC38.32■■■■□ 3.73
FRMPD1Q5SYB0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
FRMPD1Q5SYB0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
FRMPD1Q5SYB0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC38.31■■■■□ 3.72
FRMPD1Q5SYB0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
FRMPD1Q5SYB0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
FRMPD1Q5SYB0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
FRMPD1Q5SYB0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
FRMPD1Q5SYB0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
FRMPD1Q5SYB0 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
FRMPD1Q5SYB0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.3■■■■□ 3.72
FRMPD1Q5SYB0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC38.29■■■■□ 3.72
FRMPD1Q5SYB0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
FRMPD1Q5SYB0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC38.29■■■■□ 3.72
FRMPD1Q5SYB0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC38.29■■■■□ 3.72
FRMPD1Q5SYB0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
FRMPD1Q5SYB0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
FRMPD1Q5SYB0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
FRMPD1Q5SYB0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.27■■■■□ 3.72
FRMPD1Q5SYB0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
FRMPD1Q5SYB0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC38.27■■■■□ 3.72
FRMPD1Q5SYB0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
FRMPD1Q5SYB0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.26■■■■□ 3.72
FRMPD1Q5SYB0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC38.26■■■■□ 3.72
FRMPD1Q5SYB0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
FRMPD1Q5SYB0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.25■■■■□ 3.71
FRMPD1Q5SYB0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.24■■■■□ 3.71
FRMPD1Q5SYB0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC38.24■■■■□ 3.71
FRMPD1Q5SYB0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC38.24■■■■□ 3.71
FRMPD1Q5SYB0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC38.24■■■■□ 3.71
FRMPD1Q5SYB0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
FRMPD1Q5SYB0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
FRMPD1Q5SYB0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC38.21■■■■□ 3.71
FRMPD1Q5SYB0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC38.21■■■■□ 3.71
FRMPD1Q5SYB0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC38.21■■■■□ 3.71
FRMPD1Q5SYB0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
FRMPD1Q5SYB0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC38.19■■■■□ 3.7
FRMPD1Q5SYB0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC38.19■■■■□ 3.7
FRMPD1Q5SYB0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC38.19■■■■□ 3.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms